基因页:HKDC1
概括?
基因 | 80201 |
象征 | HKDC1 |
同义词 | - |
描述 | 含有1个的己糖激酶结构域 |
参考 | HGNC:HGNC:23302|ENSEMBL:ENSG00000156510|HPRD:08006|Vega:Otthumg0000000018371 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q22.1 |
Pascal P值 | 0.356 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG11639651 | 10 | 70979811 | HKDC1 | 3.106E-4 | -0.491 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SH3GLB1 | 0.83 | 0.82 |
RNF180 | 0.83 | 0.82 |
B3GALNT1 | 0.82 | 0.81 |
derl1 | 0.80 | 0.82 |
Smarca1 | 0.80 | 0.83 |
HMGCS1 | 0.79 | 0.84 |
FBXO3 | 0.79 | 0.82 |
PKIA | 0.79 | 0.80 |
BIRC2 | 0.78 | 0.82 |
mgat4c | 0.78 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.60 | -0.70 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.68 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.68 |
AF347015.27 | -0.57 | -0.65 |
AF347015.33 | -0.57 | -0.65 |
mt-cyb | -0.56 | -0.67 |
FXYD1 | -0.54 | -0.62 |
AF347015.2 | -0.54 | -0.68 |
HLA-F | -0.54 | -0.58 |
AF347015.15 | -0.54 | -0.66 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cervera SDHB目标2 | 114 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标3 | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |