基因页:Rab11fip1
概括?
基因 | 80223 |
象征 | Rab11fip1 |
同义词 | noel1a | rcp | rab11-fip1 |
描述 | Rab11家族相互作用蛋白1(I类) |
参考 | MIM:608737|HGNC:HGNC:30265|ENSEMBL:ENSG00000156675|HPRD:09787|Vega:Otthumg00000164026 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p11.22 |
Pascal P值 | 0.052 |
胎儿β | -0.704 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22881435 | 8 | 37732086 | Rab11fip1 | 1.325E-4 | 0.283 | 0.03 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16869851 | CHR4 | 20690056 | Rab11fip1 | 80223 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RAB11FIP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳腺癌导管与小叶 | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘普通癌基因 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林被肿瘤微环境沉默 | 108 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8p12 P11扩增子 | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 2小时的回应 | 53 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |