基因页：prex2
概括？
| 基因 | 80243 |
| 象征 | prex2 |
| 同义词 | 6230420n16rik | dep.2 | depdc2 | p-rex2 | ppp1r129 |
| 描述 | 磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸依赖性RAC交换因子2 |
| 参考 | MIM：612139|HGNC：HGNC：22950|HPRD：13135| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8Q13.2 |
| Pascal P值 | 0.021 |
| 胎儿β | -0.315 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12679192 | 8 | 68969455 | prex2 | 2.408E-4 | 0.342 | 0.037 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11927611 | CHR3 | 17848434 | prex2 | 80243 | 0.13 | 反式 | ||
| RS4541797 | CHR7 | 66887845 | prex2 | 80243 | 0.02 | 反式 | ||
| RS7899106 | Chr10 | 87410903 | prex2 | 80243 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID Rac1 Reg Pathway | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |