概括
基因 80254
象征 CEP63
同义词 SCKL6
描述 中心蛋白63KDA
参考 MIM:614724|HGNC:HGNC:25815|ENSEMBL:ENSG00000182923|HPRD:07826|Vega:Otthumg00000159725
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q22.2
Pascal P值 0.876
胎儿β 0.666
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07207858 3 134204910 CEP63 2.22e-9 -0.011 1.72E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12812986
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005813 中心体 艾达 14654843

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 81 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-23 289 296 1A,M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc