基因页:CEP63
概括?
基因 | 80254 |
象征 | CEP63 |
同义词 | SCKL6 |
描述 | 中心蛋白63KDA |
参考 | MIM:614724|HGNC:HGNC:25815|ENSEMBL:ENSG00000182923|HPRD:07826|Vega:Otthumg00000159725 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q22.2 |
Pascal P值 | 0.876 |
胎儿β | 0.666 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07207858 | 3 | 134204910 | CEP63 | 2.22e-9 | -0.011 | 1.72E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CEP63_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12812986 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005813 | 中心体 | 艾达 | 14654843 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 | 81 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-23 | 289 | 296 | 1A,M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc |