基因页:CUBN
概括?
基因 | 8029 |
象征 | CUBN |
同义词 | IFCR | MGA1 | GP280 |
描述 | Cubilin |
参考 | MIM:602997|HGNC:HGNC:2548|Ensembl:ENSG00000107611|HPRD:04296|Vega:Otthumg0000000017741 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10p12.31 |
Pascal P值 | 0.198 |
胎儿β | 0.534 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22980697 | 10 | 16874865 | CUBN | 4.44e-5 | 0.699 | 0.021 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CUBN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
类固醇激素和维生素A和D的反应组代谢 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HDL介导的脂质转运 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组类固醇激素 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome脂质消化和运输 | 46 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂蛋白代谢 | 28 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
苏肾 | 15 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼(Hoffmann | 75 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染30分钟DN | 150 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标3 | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |