概括
基因 80308
象征 flad1
同义词 fad1 | fads | pp591
描述 黄素腺嘌呤二核苷酸合成酶1
参考 MIM:610595|HGNC:HGNC:24671|ENSEMBL:ENSG00000160688|HPRD:17887|Vega:Otthumg0000000037416
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21.3
Sherlock P值 0.117
TADA P值 0.002
胎儿β 1.169
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 3
DNM:Gulsuner_2013 整个外显子组测序分析 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
flad1 CHR1 154960684 t nn NM_001184891
NM_001184892
NM_025207
NM_201398



边框
边框
边框
边框
精神分裂症 DNM:Gulsuner_2013

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01366407 1 154955991 flad1 5.266E-4 4.391 DMG:Vaneijk_2014
CG20977411 1 154909454 flad1 5.804e-4 3.619 DMG:Vaneijk_2014
CG15470750 1 155278344 flad1 7.44e-4 3.079 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003919 FMN腺苷酸转移酶活性 经验 16643857
去:0003919 FMN腺苷酸转移酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0006777 Mo-Molybdopterin辅因子生物合成过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 16643857

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg核黄素代谢 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维生素和辅因子的反应组代谢 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge缺氧DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向 41 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌1Q21 AMPLICON 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN 81 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IE86 CMV蛋白的歌曲目标 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因