基因页面:LRRC27
总结吗?
| GeneID | 80313年 |
| 象征 | LRRC27 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 富亮氨酸重复包含27个 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 29346|运用:ENSG00000148814|HPRD: 17451|织女:OTTHUMG00000019284 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10 q26.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.802 |
| 夏洛克假定值 | 0.92 |
| 胎儿β | 0.561 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.03487 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg27016988 | 10 | 134186967 | LRRC27 | 3.635的军医 | 0.246 | 0.042 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs12269628 | 10 | 134130159 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 2.863 e-8 | 0 | -15455年 | gtex_brain_ba24 |
| rs76502537 | 10 | 134139068 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 7.153 e-8 | 0 | -6546年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6560691 | 10 | 134140245 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 7.371 e-8 | 0 | -5369年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7085852 | 10 | 134144005 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 1.116 e-8 | 0 | -1609年 | gtex_brain_ba24 |
| rs76805118 | 10 | 134144739 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 3.181 e-9 | 0 | -875年 | gtex_brain_ba24 |
| rs3923974 | 10 | 134146084 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 3.181 e-9 | 0 | 470年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2295273 | 10 | 134150920 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 3.181 e-9 | 0 | 5306年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7912110 | 10 | 134152214 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 2.239 e-9 | 0 | 6600年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7098749 | 10 | 134157220 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 1.554平台以及 | 0 | 11606年 | gtex_brain_ba24 |
| rs11146339 | 10 | 134158448 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 2.934 e-9 | 0 | 12834年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4612718 | 10 | 134158940 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 1.78 e-9 | 0 | 13326年 | gtex_brain_ba24 |
| rs55813610 | 10 | 134163693 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 2.431 e - | 0 | 18079年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7090409 | 10 | 134164622 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 6.034 e-9 | 0 | 19008年 | gtex_brain_ba24 |
| rs56678407 | 10 | 134167502 | LRRC27 | ENSG00000148814.13 | 1.38 e-9 | 0 | 21888年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗2 | 473年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN髓质标记 | 81年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 科茨巨噬细胞M1和M2 DN | 78年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 杨BCL3目标了 | 364年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |