基因页面:ZKSCAN3
总结吗?
| GeneID | 80317年 |
| 象征 | ZKSCAN3 |
| 同义词 | ZF47 | ZFP306 | ZNF306 | ZNF309 | ZSCAN13 | ZSCAN35 | Zfp47 | dJ874C20.1 | dJ874C20.1。| zfp-47 |
| 描述 | 锌指带和扫描域3 |
| 参考 | MIM: 612791|HGNC: HGNC: 13853|运用:ENSG00000189298|HPRD: 11705|织女:OTTHUMG00000014521 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p22 . 1 |
| 帕斯卡假定值 | 1 e-12 |
| eGene | 小脑半球 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16869851 | chr4 | 20690056 | ZKSCAN3 | 80317年 | 0.11 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GIMAP6 | 0.55 | 0.50 |
| AOC3 | 0.54 | 0.53 |
| GJA5 | 0.54 | 0.46 |
| EMCN | 0.48 | 0.42 |
| FAM26E | 0.48 | 0.42 |
| PGM5 | 0.47 | 0.52 |
| CALCRL | 0.46 | 0.46 |
| ASPN | 0.45 | 0.42 |
| GIMAP4 | 0.45 | 0.43 |
| CARD6 | 0.45 | 0.44 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC132872.1 | -0.28 | -0.37 |
| UPF3A | -0.28 | -0.32 |
| RBMX2 | -0.26 | -0.39 |
| ANKZF1 | -0.26 | -0.29 |
| SFRS16 | -0.26 | -0.26 |
| SNHG12 | -0.25 | -0.38 |
| RP9 | -0.25 | -0.34 |
| PABPN1 | -0.25 | -0.30 |
| C22orf23 | -0.25 | -0.27 |
| TEKT2 | -0.25 | -0.28 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003700 | 转录因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME通用转录途径 | 352年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 击倒老化肌肉了 | 244年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 击倒卡路里限制肌肉 | 95年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑FOXP3在胸腺的目标 | 196年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-124/506 | 422年 | 428年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||