基因页面:SP6
总结吗?
| GeneID | 80320年 |
| 象征 | SP6 |
| 同义词 | EPFN | EPIPROFIN | KLF14 |
| 描述 | Sp6转录因子 |
| 参考 | MIM: 608613|HGNC: HGNC: 14530|运用:ENSG00000189120|HPRD: 12269|织女:OTTHUMG00000132067 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 17 q21.32 |
| 帕斯卡假定值 | 0.197 |
| 胎儿β | 0.237 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg16779251 | 17 | 45928077 | SP6 | 4.295的军医 | -0.319 | 0.045 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs17799628 | chr9 | 106442995 | SP6 | 80320年 | 0.16 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RAB3B | 0.63 | 0.59 |
| ORAI2 | 0.62 | 0.60 |
| C11orf90 | 0.62 | 0.61 |
| RNF220 | 0.62 | 0.59 |
| CACNA2D3 | 0.61 | 0.57 |
| APBA1 | 0.61 | 0.63 |
| CDR2 | 0.61 | 0.60 |
| OTUB2 | 0.61 | 0.54 |
| C3orf18 | 0.60 | 0.64 |
| RPS6KA1 | 0.60 | 0.58 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.39 | -0.38 |
| AF347015.18 | -0.35 | -0.34 |
| AF347015.31 | -0.35 | -0.34 |
| AL139819.3 | -0.34 | -0.41 |
| AF347015.8 | -0.34 | -0.33 |
| MT-ATP8 | -0.34 | -0.35 |
| GNG11 | -0.34 | -0.38 |
| AF347015.27 | -0.33 | -0.33 |
| MT-CO2 | -0.33 | -0.32 |
| AF347015.2 | -0.33 | -0.27 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTORIATI MDM4目标胎儿肝脏 | 227年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多亏尤文和病毒GPCR信号 | 86年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时 | 487年 | 286年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃晚期造血祖 | 544年 | 307年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF和H3K27ME3连结控制协定 | 70年 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |