基因页:CCDC68
概括?
基因 | 80323 |
象征 | CCDC68 |
同义词 | SE57-1 |
描述 | 包含68 |
参考 | HGNC:HGNC:24350|ENSEMBL:ENSG00000166510|HPRD:18034|Vega:Otthumg00000132708 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q21 |
Pascal P值 | 0.31 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:RIPKE_2013 | 全基因组协会研究 | 多阶段GWA,瑞典人口和PGC2。24个领先的SNP | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CCDC68_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gargalovic对氧化磷脂的反应灰色 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞 | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita在前列腺癌中甲基化 | 57 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞DN | 216 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Gist vs滑膜肉瘤DN | 20 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) | 98 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Winzen通过KHSRP退化 | 100 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移6 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |