基因页面:REEP4
总结吗?
GeneID | 80346年 |
象征 | REEP4 |
同义词 | C8orf20 | PP432 | Yip2c |
描述 | 受体辅助蛋白4 |
参考 | MIM: 609349|HGNC: HGNC: 26176|运用:ENSG00000168476|HPRD: 09864|织女:OTTHUMG00000131491 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 8 . 3 |
帕斯卡假定值 | 0.427 |
夏洛克假定值 | 0.396 |
胎儿β | 0.402 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.031 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.03086 | |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.00057 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg16256610 | 8 | 21999381 | REEP4 | -0.02 | 0.85 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10842688 | chr12 | 26338293 | REEP4 | 80346年 | 0.15 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/REEP4_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
DAVICIONI分子武器VS erm DN | 182年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RODWELL肾脏老化了 | 487年 | 303年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
丰田MIR34B和MIR34C的目标 | 463年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG EGF间隔DN | 214年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-26 | 357年 | 363年 | m8 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
miR-9 | 190年 | 196年 | m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |