基因页面:TNKS2
总结吗?
| GeneID | 80351年 |
| 象征 | TNKS2 |
| 同义词 | ARTD6 | PARP-5b | PARP-5c | PARP5B | PARP5C | TANK2 | TNKL | pART6 |
| 描述 | tankyrase 2 |
| 参考 | MIM: 607128|HGNC: HGNC: 15677|运用:ENSG00000107854|HPRD: 06182|织女:OTTHUMG00000018747 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10 q23.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.061 |
| 胎儿β | 0.427 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg19912736 | 10 | 93567154 | TNKS2 | 1.638的军医 | 0.424 | 0.033 | DMG: Wockner_2014 |
| cg11963436 | 10 | 93567261 | TNKS2 | 4.123的军医 | 0.663 | 0.044 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1570589 | chr9 | 116874354 | TNKS2 | 80351年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs10994209 | chr10 | 61877705 | TNKS2 | 80351年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TRPV2 | 0.70 | 0.47 |
| CR392039.3 | 0.69 | 0.23 |
| AC130364.2 | 0.69 | 0.46 |
| SIRPB1 | 0.69 | 0.26 |
| HISPPD2A | 0.65 | 0.55 |
| PTPRN | 0.64 | 0.59 |
| SRPR | 0.64 | 0.61 |
| AC134878.1 | 0.63 | 0.13 |
| KCNJ9 | 0.63 | 0.46 |
| CLSTN3 | 0.63 | 0.64 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FAM36A | -0.29 | -0.16 |
| C21orf57 | -0.27 | -0.25 |
| GTF3C6 | -0.25 | -0.21 |
| BCL7C | -0.25 | -0.33 |
| IMPA2 | -0.23 | -0.38 |
| SNHG12 | -0.23 | -0.29 |
| AC090186.1 | -0.23 | -0.18 |
| RPL31 | -0.23 | -0.26 |
| RPL35 | -0.23 | -0.27 |
| RPS20 | -0.22 | -0.28 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOOI ST7目标了 | 94年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘CMYB目标了 | 165年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘VMYB目标了 | 127年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王CLIM2 DN的目标 | 186年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 奥斯曼膀胱癌了 | 404年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SENESE HDAC3目标了 | 501年 | 327年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN YOSHIMURA MAPK8目标 | 366年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOUDOUKHA受IGF2BP2 | 111年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |