基因页面:RNF39
总结吗?
| GeneID | 80352年 |
| 象征 | RNF39 |
| 同义词 | HZF | HZFW | LIRF |
| 描述 | 无名指蛋白质39 |
| 参考 | MIM: 607524|HGNC: HGNC: 18064|运用:ENSG00000204618|HPRD: 09600|织女:OTTHUMG00000031288 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 . 3 |
| 帕斯卡假定值 | 2.975 e-14 |
| 胎儿β | -0.446 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 4 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg12633154 | 6 | 30039435 | RNF39 | 8.78 e-5 | -0.83 | 0.027 | DMG: Wockner_2014 |
| cg11724134 | 6 | 30043727 | RNF39 | 8.83 e-5 | -0.521 | 0.027 | DMG: Wockner_2014 |
| cg10568066 | 6 | 30039442 | RNF39 | 2.083的军医 | -0.92 | 0.035 | DMG: Wockner_2014 |
| cg13401893 | 6 | 30039432 | RNF39 | 3.865的军医 | -0.768 | 0.043 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7370564 | 0 | RNF39 | 80352年 | 0.14 | 反式 | |||
| rs443832 | chr16 | 83779643 | RNF39 | 80352年 | 0.16 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | NAS | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0008150 | biological_process | ND | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005575 | cellular_component | ND | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CHARAFE乳腺癌基底与间充质 | 121年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN MOHANKUMAR TLX1目标 | 193年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化和管理不善的DN | 382年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐gh自分泌的目标 | 268年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 西方肾上腺皮质肿瘤DN | 546年 | 362年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO FGFR1在前列腺癌模型的目标 | 289年 | 184年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-29 | 332年 | 339年 | 1、m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||