Summary
基因 8038
象征 ADAM12
Synonyms ADAM12-OT1 | CAR10 | MCMP | MCMPMLTNA | MLTN | MLTNA
Description 亚当metallopeptidase域12
Reference MIM:602714|HGNC:HGNC:190|ENSEMBL:ENSG00000148848|HPRD:04092|Vega:Otthumg0000000019243
基因类型 蛋白质编码
地图location 10Q26
Pascal P值 0.016
胎儿β 0.517
主持人 Myers' cis & trans

Gene in Data Sources
基因集名称 Method of gene set Description 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03487
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 ADAM12 8038 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
BXDC2 0.92 0.91
YWHAE 0.91 0.90
OLA1 0.90 0.88
C11orf58 0.90 0.90
DNAJC8 0.90 0.87
txnl1 0.90 0.89
COPS3 0.89 0.90
mmadhc 0.89 0.92
TAF7 0.89 0.89
C7orf38 0.89 0.88
前10个负共表达基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.2 -0.66 -0.75
mt-cyb -0.65 -0.73
MT-CO2 -0.65 -0.71
AF347015.33 -0.65 -0.73
AF347015.26 -0.65 -0.75
AF347015.15 -0.64 -0.73
HLA-F -0.64 -0.70
AF347015.8 -0.63 -0.71
AF347015.31 -0.62 -0.69
AF347015.9 -0.62 -0.72

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0004222 金属肽酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0017124 SH3域结合 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
GO:0046872 metal ion binding IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007155 cell adhesion IEA -
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0007520 肌细胞融合 TAS 7566181
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 TAS 7566181

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
Biocarta Cardiacegf途径 18 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Notch途径 59 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID整合素A9B1途径 25 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Syndecan 4途径 32 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EGFR在癌症中的反应组信号传导 109 80 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LU TUMOR VASCULATURE UP 29 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房小叶癌与导管正常 69 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TURASHVILI BREAST LOBULAR CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL DN 74 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS UP 579 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
vecchi胃癌先进与早期 175 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jaeger转移 44 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1签名3 341 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SENESE HDAC3 TARGETS UP 501 327 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌 443 294 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶标为B 26 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
AML1 MTG8融合DN的DUNNE目标 19 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53目标 1174 695 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROVERSI GLIOMA COPY NUMBER DN 54 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 121 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onder CDH1目标2向上 256 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WEBER METHYLATED IN COLON CANCER 18 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN 371 218 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nielsen Gist vs滑膜肉瘤 19 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindvall因TERT DN永生 80 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成5 126 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染18小时DN 178 121 All SZGR 2.0 genes in this pathway
su胎盘 30 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KYNG DNA DAMAGE BY UV 62 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kyng DNA损坏 226 164 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kondo EZH2目标 245 148 All SZGR 2.0 genes in this pathway
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu肿瘤内皮标记 22 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CCND1 MYC的王肿瘤转化 21 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF的反应 418 282 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 245 150 All SZGR 2.0 genes in this pathway
池子侵入性乳腺癌 288 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VERHAAK GLIOBLASTOMA MESENCHYMAL 216 130 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向 504 321 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2靶向DN 882 538 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
anastassiou癌症间充质过渡特征 64 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durand Stroma S向上 297 194 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM监管机构 238 125 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA MATRISOME ASSOCIATED 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA MATRISOME 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌簇4 19 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-130/301 38 45 1A,M8 HSA-MIR-130Abrain cagugcaauguaaaaggggau
hsa-miR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130bbrain Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-19 37 43 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir-26 306 312 1a HSA-MIR-26Abrain UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-29 159 165 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu