基因页面:小鼠
总结吗?
GeneID | 80381年 |
象征 | 小鼠 |
同义词 | 4 ig-b7-h3 | B7-H3 | B7H3 | B7RP-2 |
描述 | 小鼠分子 |
参考 | MIM: 605715|HGNC: HGNC: 19137|运用:ENSG00000103855|HPRD: 05756|织女:OTTHUMG00000137585 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 15 q23-q24 |
帕斯卡假定值 | 0.065 |
胎儿β | 0.207 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CD276_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LANCL1 | 0.86 | 0.85 |
ARL8B | 0.85 | 0.85 |
FAM179B | 0.84 | 0.80 |
DDHD2 | 0.84 | 0.80 |
SYT11 | 0.84 | 0.81 |
NAPG | 0.83 | 0.82 |
C2orf30 | 0.83 | 0.81 |
NCOA7 | 0.83 | 0.81 |
化学加工 | 0.82 | 0.83 |
GPR180 | 0.82 | 0.84 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
IL32 | -0.45 | -0.42 |
CLEC3B | -0.43 | -0.52 |
AF347015.18 | -0.42 | -0.29 |
AF347015.21 | -0.41 | -0.27 |
MYLK2 | -0.41 | -0.39 |
AC010300.1 | -0.41 | -0.40 |
FAM159B | -0.40 | -0.47 |
RP9P | -0.39 | -0.41 |
EFEMP2 | -0.39 | -0.42 |
BTBD17 | -0.39 | -0.46 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005102 | 受体结合 | NAS | 神经递质(术语级别:4) | 11224528 |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0008283 | 细胞增殖 | NAS | 11224528 | |
去:0042102 | 积极的调控T细胞增殖 | 艾达 | 11224528 | |
去:0050776 | 调节免疫反应 | NAS | 11224528 | |
去:0045078 | 积极的监管移行细胞生物合成的过程 | 艾达 | 11224528 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | NAS | 15188059 | |
去:0009897 | 质膜外的一面 | NAS | 15188059 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞粘附分子凸轮 | 134年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王CLIM2目标了 | 269年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERENJENO改变了RHOA DN | 394年 | 258年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SHETH肝癌VS TXNIP PAM2损失 | 153年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ELK3严重缺氧 | 209年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过HIF1A严重缺氧 | 77年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ELK3严重缺氧,HIF1A DN | 103年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
唱转移基质上 | 110年 | 70年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伯顿脂肪生成8 | 86年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
汉物信号了 | 35 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 | 428年 | 266年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOCHKIS FOXA2目标 | 425年 | 261年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标3 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PASINI SUZ12目标 | 315年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-29 | 1339年 | 1346年 | 1、m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU |