基因页面:THSD7B
总结吗?
GeneID | 80731年 |
象征 | THSD7B |
同义词 | - - - - - - |
描述 | 血小板反应蛋白1型域包含7 b |
参考 | HGNC: HGNC: 29348|运用:ENSG00000144229|织女:OTTHUMG00000153590 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 2 q22.1 |
帕斯卡假定值 | 0.117 |
胎儿β | 2.505 |
eGene | 小脑半球 小脑 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.023 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.02395 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/THSD7B_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KCNJ12 | 0.75 | 0.69 |
ADRA1D | 0.74 | 0.83 |
GPR26 | 0.71 | 0.78 |
ADARB2 | 0.70 | 0.59 |
ANKRD34C | 0.70 | 0.73 |
KCNC2 | 0.70 | 0.70 |
KCNH5 | 0.70 | 0.46 |
GLRA3 | 0.69 | 0.66 |
RASGRF1 | 0.68 | 0.76 |
RASSF5 | 0.68 | 0.75 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RBMX2 | -0.31 | -0.51 |
KIAA1949 | -0.31 | -0.34 |
TUBB2B | -0.30 | -0.43 |
AF186192.1 | -0.30 | -0.38 |
CARHSP1 | -0.30 | -0.50 |
RPS6 | -0.30 | -0.46 |
ZNF435 | -0.30 | -0.37 |
TXNIP | -0.30 | -0.36 |
C14orf93 | -0.30 | -0.41 |
GPR125 | -0.30 | -0.33 |
第三部分。基因本体论注释
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3 UNMETHYLATED | 228年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 124.1 | 33 | 40 | 1、m8 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
miR-124/506 | 33 | 39 | 1 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir - 183 | 1056年 | 1062年 | m8 | hsa - mir - 183 | UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG |
mir - 203.1 | 529年 | 535年 | 1 | hsa - mir - 203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
mir - 219 | 335年 | 341年 | m8 | hsa - mir - 219大脑 | UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU |
miR-30-3p | 241年 | 247年 | 1 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
mir - 329 | 207年 | 213年 | m8 | hsa - mir - 329大脑 | AACACACCUGGUUAACCUCUUU |
mir - 331 | 584年 | 591年 | 1、m8 | hsa - mir - 331大脑 | GCCCCUGGGCCUAUCCUAGAA |
mir - 433 - 3 - p | 503年 | 509年 | 1 | hsa - mir - 433大脑 | AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU |