概括
基因 80736
象征 SLC44A4
同义词 c6orf29 | ctl4 | ng22 | tppt
描述 Solute Carrier家族44成员4
参考 MIM:606107|HGNC:HGNC:13941|Ensembl:ENSG00000204385|HPRD:12087|Vega:Otthumg00000031133
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 1E-12
Sherlock P值 0.177
胎儿β -0.112

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NAPSB 0.42 0.32
BDH1 0.42 0.41
PPAP2A 0.42 0.42
htatip2 0.41 0.37
sftpc 0.41 0.42
AZGP1 0.41 0.43
HSPB8 0.41 0.42
ETFDH 0.41 0.41
clybl 0.41 0.35
DHX58 0.40 0.38
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
YBX1 -0.37 -0.36
PPP1R14B -0.37 -0.41
tubb2b -0.36 -0.34
pafah1b3 -0.36 -0.42
CD24 -0.36 -0.34
塔布 -0.36 -0.37
IGFBP2 -0.36 -0.43
MEX3D -0.36 -0.39
GLTSCR2 -0.36 -0.35
SF3A2 -0.35 -0.36

第三节。基因本体论注释

细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC的Reactome合成 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 89 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胺化合物SLC转运蛋白 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 UP 112 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维克曼石棉肺癌 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘鼻咽癌 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脑DN中的乳腺癌复发 85 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1和SATB1的Purbey目标 87 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟 116 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因