基因页面:LY6G5C
总结吗?
| GeneID | 80741年 |
| 象征 | LY6G5C |
| 同义词 | C6orf20 | G5C | LY6G5CA | LY6G5CB | NG33 |
| 描述 | 淋巴细胞抗原6复杂轨迹G5C |
| 参考 | MIM: 610434|HGNC: HGNC: 13932|运用:ENSG00000204428|HPRD: 14328|织女:OTTHUMG00000031228 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p21.33 |
| 帕斯卡假定值 | 1.442 e-12 |
| 夏洛克假定值 | 0.082 |
| 胎儿β | 0.531 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7584986 | chr2 | 184111432 | LY6G5C | 80741年 | 8.943的军医 | 反式 | ||
| rs1368303 | chr5 | 147672388 | LY6G5C | 80741年 | 3.475 e-5 | 反式 | ||
| rs16955618 | chr15 | 29937543 | LY6G5C | 80741年 | 2.685的军医 | 反式 | ||
| snp_a - 1830894 | 0 | LY6G5C | 80741年 | 0 | 反式 | |||
| rs16990006 | chrX | 32014626 | LY6G5C | 80741年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs2242660 | 6 | 31597753 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 4.034 e-8 | 0 | 54064年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs7029 | 6 | 31629953 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.481平台以及 | 0 | 21864年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs1266076 | 6 | 31640518 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.674 e-8 | 0 | 11299年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs805290 | 6 | 31648403 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.481平台以及 | 0 | 3414年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9279386 | 6 | 31650592 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.453平台以及 | 0 | 1225年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1266075 | 6 | 31653120 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 4.31 e-9 | 0 | -1303年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs707918 | 6 | 31654732 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.481平台以及 | 0 | -2915年 | gtex_brain_ba24 |
| rs707917 | 6 | 31657754 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.481平台以及 | 0 | -5937年 | gtex_brain_ba24 |
| rs805282 | 6 | 31659731 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.481平台以及 | 0 | -7914年 | gtex_brain_ba24 |
| rs805281 | 6 | 31661489 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.481平台以及 | 0 | -9672年 | gtex_brain_ba24 |
| rs805280 | 6 | 31662229 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.861平台以及 | 0 | -10412年 | gtex_brain_ba24 |
| rs805277 | 6 | 31662957 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 5.749 e-9 | 0 | -11140年 | gtex_brain_ba24 |
| rs805276 | 6 | 31664219 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 4.11平台以及 | 0 | -12402年 | gtex_brain_ba24 |
| rs805274 | 6 | 31665194 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.481平台以及 | 0 | -13377年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1266073 | 6 | 31667028 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 2.518 e-9 | 0 | -15211年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2242660 | 6 | 31597753 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 5.903 e - | 0 | 54064年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2844465 | 6 | 31601022 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 5.903 e - | 0 | 50795年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2242659 | 6 | 31601513 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 5.903 e - | 0 | 50304年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805303 | 6 | 31616366 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 5.903 e - | 0 | 35451年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805302 | 6 | 31617957 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 5.95 e - | 0 | 33860年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805301 | 6 | 31618121 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 5.903 e - | 0 | 33696年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs813115 | 6 | 31620020 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 5.74 e - | 0 | 31797年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs707920 | 6 | 31629096 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | 22721年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7029 | 6 | 31629953 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | 21864年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7992 | 6 | 31630241 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | 21576年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805260 | 6 | 31630831 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 2.428 e - | 0 | 20986年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805257 | 6 | 31634193 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 8.351 e-8 | 0 | 17624年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs14365 | 6 | 31635710 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 9.693 e-9 | 0 | 16107年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34561980 | 6 | 31635958 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 6.854 e-8 | 0 | 15859年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34161953 | 6 | 31635963 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 6.808 e - | 0 | 15854年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4569 | 6 | 31637807 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 2.402 e15汽油 | 0 | 14010年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1266076 | 6 | 31640518 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 7.783 e-8 | 0 | 11299年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805271 | 6 | 31643251 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | 8566年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805290 | 6 | 31648403 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | 3414年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9279386 | 6 | 31650592 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.308 e-16 | 0 | 1225年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1266075 | 6 | 31653120 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 8.214 e-16 | 0 | -1303年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9281553 | 6 | 31653579 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 7.09 e-16 | 0 | -1762年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs707918 | 6 | 31654732 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | -2915年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs707917 | 6 | 31657754 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | -5937年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805282 | 6 | 31659731 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | -7914年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805281 | 6 | 31661489 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | -9672年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805280 | 6 | 31662229 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 2.781 e-13 | 0 | -10412年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805277 | 6 | 31662957 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.925 e-16 | 0 | -11140年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805276 | 6 | 31664219 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 7.488 e-17 | 0 | -12402年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805274 | 6 | 31665194 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.646 e-16 | 0 | -13377年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1266073 | 6 | 31667028 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.917 e-13 | 0 | -15211年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805288 | 6 | 31678028 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 3.894 e-12 | 0 | -26211年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805287 | 6 | 31678730 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 7.668 e-11 | 0 | -26913年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805286 | 6 | 31679307 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 1.177 e - | 0 | -27490年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs805285 | 6 | 31679465 | LY6G5C | ENSG00000204428.8 | 6.019 e-8 | 0 | -27648年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ODONNELL TFRC目标了 | 456年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 压抑的徐HGF目标AKT1 DN | 95年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RIZKI肿瘤侵袭性的3 d DN | 270年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 | 344年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |