基因页：PRR3
概括？
| 基因 | 80742 |
| 象征 | PRR3 |
| 同义词 | CAT56 |
| 描述 | Proline Rich 3 |
| 参考 | HGNC：HGNC：21149|HPRD：17915| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.33 |
| Pascal P值 | 2.098e-14 |
| Sherlock P值 | 0.192 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23654545 | 6 | 30525120 | prr3; gnl1 | 3.853E-4 | -0.207 | 0.043 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CUGBP1 | 0.86 | 0.87 |
| ZNF490 | 0.86 | 0.86 |
| NSD1 | 0.86 | 0.87 |
| crkrs | 0.85 | 0.86 |
| DDX6 | 0.85 | 0.88 |
| tug1 | 0.85 | 0.86 |
| USP24 | 0.85 | 0.85 |
| ZNF141 | 0.85 | 0.87 |
| N4BP1 | 0.85 | 0.87 |
| BIRC6 | 0.85 | 0.86 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.67 | -0.78 |
| AF347015.31 | -0.67 | -0.77 |
| AF347015.27 | -0.66 | -0.75 |
| mt-cyb | -0.65 | -0.75 |
| AF347015.8 | -0.64 | -0.76 |
| ifi27 | -0.64 | -0.74 |
| AF347015.21 | -0.64 | -0.81 |
| FXYD1 | -0.64 | -0.74 |
| AF347015.33 | -0.64 | -0.72 |
| higd1b | -0.64 | -0.75 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Grasemann视网膜细胞瘤，具有6p扩增 | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser MYC靶标和血清反应 | 47 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 叶转移性肝癌 | 27 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 5 | 11 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-182 | 698 | 704 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-224 | 668 | 674 | M8 | HSA-MIR-224 | caagucacuaguguguccuuua |
| mir-27 | 1044 | 1050 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-29 | 306 | 312 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| mir-324-3p | 1055 | 1061 | 1a | HSA-MIR-324-3P | ccacugccccaggugcugcugg |
| mir-330 | 612 | 618 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-34b | 777 | 783 | M8 | HSA-MIR-34B | uaggcagugucauagcugauug |
| mir-378 | 1097 | 1103 | M8 | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
| mir-96 | 698 | 704 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |