基因页：COL18A1

Summary？
基因 80781
象征 COL18A1
同义词 kno | kno1 | ks
描述 胶原型XVIII Alpha 1
参考 MIM：120328|HGNC：HGNC：2195|ENSEMBL：ENSG00000182871|HPRD：00382|Vega：Otthumg0000000090407
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.3
Pascal P值 0.07
Sherlock p-value 0.772
胎儿β -0.295
DMG 1 (# studies)
主持人 小脑半球
元

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 4

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
cg04553623 21 46909229 COL18A1 5.5e-6 -0.295 0.011 DMG：Wockner_2014
CG22978915 21 46850449 COL18A1 2.1E-4 -0.25 0.035 DMG：Wockner_2014
CG08605965 21 46891839 COL18A1 3.023E-4 0.487 0.04 DMG：Wockner_2014
CG14356919 21 46890997 COL18A1 3.411E-4 0.573 0.041 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
OSBP 0.94 0.95
hectd1 0.94 0.95
NAT12 0.94 0.94
LEMD3 0.93 0.94
3月6日 0.93 0.95
AP003115.1 0.93 0.95
FBXO45 0.93 0.94
AP1G1 0.93 0.94
PDE12 0.93 0.94
CPEB4 0.93 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.75 -0.80
MT-CO2 -0.75 -0.80
FXYD1 -0.74 -0.77
higd1b -0.73 -0.79
AF347015.21 -0.72 -0.81
AF347015.8 -0.71 -0.78
AF347015.33 -0.71 -0.73
mt-cyb -0.71 -0.75
AC021016.1 -0.70 -0.74
ifi27 -0.70 -0.74

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID Integin1途径 66 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID P53 DOWNSTREAM PATHWAY 137 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID时代基因组途径 65 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID HNF3A途径 44 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni pax foxo1手臂签名 59 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS UP 255 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
deurig t细胞促进性白血病 368 234 All SZGR 2.0 genes in this pathway
gal白血病干细胞DN 244 153 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王攀登目标 269 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LANDIS BREAST CANCER PROGRESSION DN 70 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN UP 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
悍马恶性皮肤肿瘤 16 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53目标 1174 695 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP63目标 355 243 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53和TP63目标 205 145 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HUMMERICH SKIN CANCER PROGRESSION UP 88 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 2B 392 251 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林格伦膀胱癌高复发 49 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
霍林青春期乳腺 69 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
留置权乳腺癌变质 35 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Guenther生长球形与辅助DN 26 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WU细胞迁移 184 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION UP 69 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌21q22 Amplicon 16 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rozanov MMP14目标子集 33 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rozanov MMP14靶向 266 171 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kannan TP53靶向DN 21 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LE EGR2 TARGETS UP 108 75 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马纳洛缺氧 207 145 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SANSOM APC TARGETS DN 366 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
nguyen Notch1靶向 29 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iglesias E2F目标 151 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hanson HRAS通过NFKB发出信号 22 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ongusaha TP53目标 38 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血干细胞 254 164 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAMAZAKI TCEB3 TARGETS DN 215 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成4 48 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王顺铂响应和XPC向上 202 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和内皮的钟分泌组 66 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEIN CEREBELLUM MARKERS 85 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1靶向DN 543 317 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 All SZGR 2.0 genes in this pathway
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌正常 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Le滑雪目标DN 8 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌 871 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ruiz TNC目标 153 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌克拉斯 491 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G3 DN 51 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
清肝癌亚类增殖DN 179 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway
COULOUARN颞TGFB1签名DN 138 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝脏发展DN 222 141 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块 721 492 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇的时间反应14 143 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇的时间反应16 79 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ongusaha BRCA1靶向 13 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
萨森对促性腺营养蛋白的反应 91 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sasson对Forskolin的反应 90 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向 504 321 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 430 288 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim Glis2靶向 84 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Servitja Islet HNF1A靶向 163 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞向上 489 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Naba胶原蛋白 44 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA CORE MATRISOME 275 148 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA地下室膜 40 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway