基因页:CALM3
概括?
基因 | 808 |
象征 | CALM3 |
同义词 | HEL-S-72 | PHKD | PHKD3 |
描述 | 钙调蛋白3(磷酸化酶激酶,三角洲) |
参考 | MIM:114183|HGNC:HGNC:1449|Ensembl:ENSG00000160014|HPRD:00243|Vega:Otthumg00000133517 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19Q13.2-Q13.3 |
Pascal P值 | 0.049 |
Sherlock P值 | 0.765 |
支持 | 细胞内信号转导 5-羟色胺 COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CALM3_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ASCL2 | Ash2 |哈希2 |mash2 |BHLHA45 | Achaete-Scute复合物同源2(果蝇) | - | HPRD | 10757985 |
CALD1 | CDM |H-CAD |l-cad |MGC21352 |NAG22 | Caldesmon 1 | - | HPRD | 11736632 |
CAMK2A | CAMKA |KIAA0968 | 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | - | HPRD | 11981030 |
ESR2 | er-beta |ESR-Beta |ESRB |estrb |ERB |NR3A2 | 雌激素受体2(ERβ) | - | HPRD | 11981030 |
GRM5 | gprc1e |mglur5 |mglur5a |mglur5b |mglu5 | 谷氨酸受体,代谢5 | - | HPRD | 11953448 |
GRM7 | FLJ40498 |Glur7 |gprc1g |mglur7 |mglu7 | 谷氨酸受体,代谢7 | - | HPRD | 11953448 |
HNF1A | HNF1 |LFB1 |Mody3 |TCF1 | HNF1 HONEOBOX a | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
KCNQ2 | BFNC |EBN |EBN1 |enb1 |HNSPC |KCNA11 |KV7.2 |Kvebn1 | 钾电压门控通道,类似KQT的亚家族,成员2 | - | HPRD,Biogrid | 12032157 |
KCNQ5 | KV7.5 | 钾电压门控通道,类似KQT的亚家族,成员5 | - | HPRD | 12032157 |
MAP3K7 | tak1 |TGF1A | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶7 | - | HPRD | 14743216 |
MAP3K7IP2 | FLJ21885 |KIAA0733 |TAB2 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶7相互作用蛋白2 | - | HPRD | 14743216 |
myf5 | BHLHC2 | 肌源性因子5 | - | HPRD | 10757985 |
myf6 | MRF4 |BHLHC4 | 肌原因子6(巨蛋白) | - | HPRD | 10757985 |
myo10 | FLJ10639 |FLJ21066 |FLJ22268 |FLJ43256 |KIAA0799 |MGC131988 | 肌球蛋白X | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11278607 |
myod1 | myf3 |Myod |PUM |BHLHC1 | 肌源分化1 | - | HPRD | 10757985 |
myog | myf4 |肌蛋白|BHLHC3 | 肌原(肌原因子4) | - | HPRD | 10757985 |
Neurod1 | beta2 |BHF-1 |Neurod |BHLHA3 | 神经源分化1 | - | HPRD | 10757985 |
Pinx1 | FLJ20565 |lptl |lpts |MGC8850 | PIN2相互作用蛋白1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PPEF1 | pp7 |PPEF |PPP7C | 蛋白质磷酸酶,EF手钙结合结构域1 | - | HPRD | 12051765 |
PPEF2 | - | 蛋白质磷酸酶,EF手钙结合结构域2 | - | HPRD | 12051765 |
ppyr1 | MGC116897 |NPY4-R |npy4r |pp1 |Y4 | 胰多肽受体1 | - | HPRD | 12153558 |
Rab3b | - | Rab3b,Ras Oncogene家族成员 | - | HPRD | 11741295 |
RIOK3 | DKFZP779L1370 |Sudd | 里约激酶3(酵母) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
TCF3 | e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 | 转录因子3(E2A免疫球蛋白增强子结合因子E12/E47) | - | HPRD | 10757985 |
TCF4 | E2-2 |itf2 |MGC149723 |MGC149724 |pths |sef2 |sef2-1 |SEF2-1A |sef2-1b |BHLHB19 | 转录因子4 | - | HPRD | 10757985 |
传统 | HS.89862 |MGC11078 | 通过死亡域与TNFRSF1A相关 | - | HPRD | 14743216 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg血管平滑肌收缩 | 115 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg长期增强 | 70 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 | 126 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg嗅觉转导 | 389 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg gnRH信号通路 | 101 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg黑色素发生 | 102 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg神经胶质瘤 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta No1途径 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta AT1R途径 | 36 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta BCR途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡丁生物肽途径 | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Cacam途径 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta HDAC途径 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta GCR途径 | 22 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物钙化蛋白途径 | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta ndkdynamin途径 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta FCER1途径 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta FMLP途径 | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Pyk2途径 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta VIP途径 | 29 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NFAT途径 | 56 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NOS1途径 | 24 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CCR5途径 | 20 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta PGC1A途径 | 26 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta MEF2D途径 | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta GPCR途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta TCR途径 | 49 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖原分解糖原分解 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DAG和IP3信令 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome四氢无菌蛋白BH4合成回收的挽救和调节 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的Reactome信号传导 | 101 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EGFR在癌症中的反应组信号传导 | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原激活B细胞受体,导致第二使者产生 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Enos激活和调节 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome阿片类药物信号传导 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome CA依赖性事件 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome darpp 32事件 | 25 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PLC Beta介导的事件 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome下游信号转导 | 95 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肌肉收缩 | 48 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RAS激活UOPN CA2通过NMDA受体Infux | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome平滑肌收缩 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NMDA受体在谷氨酸结合和突触后事件上的反应组激活 | 37 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Creb通过RAS激活的磷酸化 | 27 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组后NMDA受体激活事件 | 33 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Creb通过CAMKII的激活来磷酸化 | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的下游信号传导激活的FGFR | 100 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome磷脂酶C介导的级联 | 54 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
谷氨酸结合上海藻酸盐受体的反应组激活 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海藻酸盐受体的反应组离子型活性 | 11 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组葡萄糖代谢 | 69 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR的Reactome信号传导 | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
咖啡馆对THC DN的响应 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Caffarel对THC 24小时5 DN的响应 | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
郭十六进制目标 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Delta FOSB目标8WK | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee衰老的肌肉DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制新皮层DN | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
兰普早期丰富学习环境 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
朗布浓缩学习环境迟到 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变 | 180 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemello Moleus vs EDL肌纤维DN | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |