基因页：FXR1
概括？
| 基因 | 8087 |
| 象征 | FXR1 |
| 同义词 | FXR1P |
| 描述 | FMR1常染色体同源物1 |
| 参考 | MIM：600819|HGNC：HGNC：4023|ENSEMBL：ENSG00000114416|HPRD：02892|Vega：Otthumg00000158138 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q28 |
| Pascal P值 | 1.075E-10 |
| Sherlock P值 | 0.087 |
| 胎儿β | 0.731 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG27437944 | 3 | 180630533 | FXR1 | -0.027 | 0.51 | DMG：Nishioka_2013 | |
| CG19678270 | 3 | 180630780 | FXR1 | 6.27E-8 | -0.01 | 1.56E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1324669 | CHR13 | 107872446 | FXR1 | 8087 | 0.01 | 反式 | ||
| RS9949772 | CHR18 | 31042632 | FXR1 | 8087 | 0.13 | 反式 | ||
| RS17145698 | Chrx | 40218345 | FXR1 | 8087 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003723 | RNA结合 | 塔斯 | 7781595 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007519 | 骨骼肌发育 | IEA | 神经元（GO期限：8） | - |
| 去：0006915 | 凋亡 | 塔斯 | 9642279 | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005844 | 多层 | 塔斯 | 9817930 | |
| 去：0005730 | 核仁 | 塔斯 | 10888599 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 7781595 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| C14orf1 | ERG28 |Net51 | 染色体14开放阅读框1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| C1orf103 | FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 | 染色体1开放阅读框103 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| CRMP1 | dpysl1 |DRP-1 |DRP1 | 折叠蛋白反应介质蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| CYFIP1 | FLJ45151 |P140SRA-1 |Shyc |SRA1 | 细胞质FMR1相互作用蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11438699 |
| CYFIP2 | PIR121 | 细胞质FMR1相互作用蛋白2 | - | HPRD，Biogrid | 11438699 |
| FMR1 | FMRP |Fraxa |MGC87458 |pof |pof1 | 脆弱的X智力低下1 | - | HPRD，Biogrid | 7489725|8668200 |
| FXR1 | - | 脆弱的X心理障碍，常染色体同源物1 | - | HPRD，Biogrid | 7489725 |
| FXR2 | FMR1L2 | 脆弱的X心理迟缓，常染色体同源物2 | - | HPRD，Biogrid | 7489725|8668200 |
| GBP2 | - | 鸟烯基结合蛋白2，干扰素诱导 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| KIAA1377 | - | KIAA1377 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| luc7l2 | CGI-59 |CGI-74 |FLJ10657 |luc7b2 | Luc7样2（S. cerevisiae） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| PRSS23 | MGC5107 |Sig13 |SPUVE |ZSIG13 | 蛋白酶，丝氨酸，23 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌6小时DN | 167 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham CML静止与正常分裂 | 57 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham正常静止与正常分裂 | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺夫在结肠癌中突变 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YANG乳腺癌ESR1激光DN | 50 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应60 HELA | 46 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 按拷贝数量的丁肺癌表达 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DORSAM HOXA9靶向DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Honma多西他赛的抵抗 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 螺旋吸烟者肺癌 | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan变量早期分化基因DN | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 | 73 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-132/212 | 581 | 587 | M8 | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
| HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
| mir-145 | 524 | 530 | 1a | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
| mir-182 | 64 | 71 | 1A，M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-199 | 523 | 529 | 1a | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
| HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
| MiR-200BC/429 | 627 | 633 | M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| mir-25/32/92/363/367 | 815 | 822 | 1A，M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
| HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
| HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
| HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
| HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
| mir-30-3p | 706 | 713 | 1A，M8 | HSA-MIR-30A-3P | cuuucagucggauguugcagc |
| HSA-MIR-30E-3P | cuuucagucggauguauacagc | ||||
| mir-30-5p | 18 | 24 | 1a | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-31 | 63 | 69 | 1a | HSA-MIR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |
| mir-320 | 648 | 654 | 1a | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
| mir-324-3p | 575 | 582 | 1A，M8 | HSA-MIR-324-3P | ccacugccccaggugcugcugg |
| mir-493-5p | 55 | 61 | 1a | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| mir-7 | 856 | 862 | 1a | HSA-MIR-7SZ | Uggaagacuaguuuuuguug |
| mir-9 | 67 | 73 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
| mir-96 | 65 | 71 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |