Summary
GeneID 81
Symbol ACTN4
同义词 actinin-4 | FSGS | FSGS1
描述 肌动蛋白α4
参考 MIM:604638|HGNC:HGNC:166|HPRD:05222|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13
Pascal P值 0.548
胎儿β -0.814
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2Cdb.humanNRC
CompositeSet

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
ACTC1 ACTC | CMD1R | CMH11 肌动蛋白,α,心肌1 - HPRD 12042308
ATP6V1B1 ATP6B1 |MGC32642 |rta1b |vatb |VMA2 |VPP3 ATPase,H+运输,溶酶体56/58KDA,V1亚基B1 - HPRD 10915794
CAMK2A CAMKA |KIAA0968 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα CAMK2A(CAMKII-ALPHA)与ACTN4相互作用(α-肌动蛋白4)。 绑定 11160423
CAMK2A CAMKA |KIAA0968 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα Two-hybrid Biogrid 11160423
CAMK2B CAM2 | CAMK2 | CAMKB | MGC29528 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIβ Two-hybrid Biogrid 11160423
CAMK2B CAM2 | CAMK2 | CAMKB | MGC29528 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIβ CAMK2B(CAMKII-BETA)与ACTN4相互作用(α-肌动蛋白4)。 绑定 11160423
CAMK2G CAMK |CAMK-II |Camkg |FLJ16043 |MGC26678 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIγ - HPRD 11160423
Col17a1 BA16H23.2 |BP180 |BPAG2 |FLJ60881 |KIAA0204 |lad-1 胶原蛋白,第XVII型,Alpha 1 - HPRD,Biogrid 11739652
GSN DKFZP313L0718 凝胶素(淀粉样变性,芬兰类型) - HPRD,Biogrid 11733011
ITGB1 CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab 整合素,β1(纤连蛋白受体,β多肽,抗原CD29包括MDF2,MSK12) - HPRD 2116421
LRRC7 DKFZP686I1147 |KIAA1365 |MGC144918 含亮氨酸丰富的重复含有7 - HPRD 11160423
LRRC7 DKFZP686I1147 |KIAA1365 |MGC144918 含亮氨酸丰富的重复含有7 LRRC7(Densin-180) interacts with ACTN4 (alpha-Actinin 4). This interaction was modeled on a demonstrated interaction between rat LRCC7 and human ACTN4. 绑定 11160423
magi1 AIP3 | BAIAP1 | BAP1 | MAGI-1 | TNRC19 | WWP3 膜相关的鸟苷酸激酶,WW和PDZ结构域,含有1个 - HPRD,Biogrid 12042308
myoz1 CS-2 |Fatz |Myoz myozenin 1 Two-hybrid Biogrid 16189514
myoz2 C4orf5 |CS-1 myozenin 2 Two-hybrid Biogrid 16189514
DKFZP686C1456 |FLJ11505 |FLJ36536 |FLJ39568 |FLJ39584 |NEB177D |NEM2 树星 - HPRD 11882289
NOS2 hep-nos |iNos |nos |NOS2A 一氧化氮合酶2,可诱导 - HPRD 12960352
PDLIM1 攀登1 |CLP-36 |clp36 |HCLIM1 PDZ和LIM域1 - HPRD,Biogrid 10753915
PDLIM1 攀登1 |CLP-36 |clp36 |HCLIM1 PDZ和LIM域1 CLP-36 interacts with alpha-actinin 4. 绑定 10753915
SLC9A3R2 e3karp |MGC104639 |NHE3RF2 |nherf-2 |nherf2 |OCTS2 |SIP-1 |SIP1 |TKA-1 溶质载体家族9(钠/氢交换器),成员3调节剂2 - HPRD,Biogrid 11948184
trim3 BERP | FLJ16135 | HAC1 | RNF22 | RNF97 tripartite motif-containing 3 - HPRD,Biogrid 10673389
USP6NL KIAA0019 |rntre |tre2nl USP6 n末端 - HPRD,Biogrid 15152255


部分诉通路注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg焦点粘附 201 138 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg粘附交界处 75 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg thright连接点 134 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg白细胞跨内皮迁移 118 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg系统性狼疮红斑 140 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG心律失常右心肌病ARVC 76 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID PDGFRB途径 129 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome细胞通信 120 77 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME RESPONSE TO ELEVATED PLATELET CYTOSOLIC CA2 89 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组肾素相互作用 20 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组止血 466 331 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌 443 294 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa转变为可逆DN 29 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 150 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁与HDAC互动 44 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应 134 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Teramoto OPN目标群集6 27 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
狮子转移 539 324 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Koyama Sema3b靶向 292 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
taghavi肿瘤转化 12 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
AMIT SERUM RESPONSE 480 MCF10A 39 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori前BI淋巴细胞向上 80 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori未成熟B淋巴细胞DN 90 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LIN APC目标 77 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jechlinger上皮到间充质转变DN 66 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FAELT B CLL与VH3 21 UP 44 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hendricks Smarca4靶向 56 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TSENG IRS1 TARGETS UP 113 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zamora NOS2靶向DN 96 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
safford t淋巴细胞厌食 87 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GHO ATF5目标DN 16 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kyng DNA损伤DN 195 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stearman肺癌早期与晚期 125 89 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌克拉斯 491 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标汇合 567 365 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HIF1A和FOXA2的Qi缺氧靶标 37 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Delacroix Rar Bound ES 462 273 All SZGR 2.0 genes in this pathway