基因页:ACTN4
Summary?
GeneID | 81 |
Symbol | ACTN4 |
同义词 | actinin-4 | FSGS | FSGS1 |
描述 | 肌动蛋白α4 |
参考 | MIM:604638|HGNC:HGNC:166|HPRD:05222| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13 |
Pascal P值 | 0.548 |
胎儿β | -0.814 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2Cdb.humanNRC CompositeSet |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ACTN4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ACTC1 | ACTC | CMD1R | CMH11 | 肌动蛋白,α,心肌1 | - | HPRD | 12042308 |
ATP6V1B1 | ATP6B1 |MGC32642 |rta1b |vatb |VMA2 |VPP3 | ATPase,H+运输,溶酶体56/58KDA,V1亚基B1 | - | HPRD | 10915794 |
CAMK2A | CAMKA |KIAA0968 | 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα | CAMK2A(CAMKII-ALPHA)与ACTN4相互作用(α-肌动蛋白4)。 | 绑定 | 11160423 |
CAMK2A | CAMKA |KIAA0968 | 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα | Two-hybrid | Biogrid | 11160423 |
CAMK2B | CAM2 | CAMK2 | CAMKB | MGC29528 | 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIβ | Two-hybrid | Biogrid | 11160423 |
CAMK2B | CAM2 | CAMK2 | CAMKB | MGC29528 | 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIβ | CAMK2B(CAMKII-BETA)与ACTN4相互作用(α-肌动蛋白4)。 | 绑定 | 11160423 |
CAMK2G | CAMK |CAMK-II |Camkg |FLJ16043 |MGC26678 | 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIγ | - | HPRD | 11160423 |
Col17a1 | BA16H23.2 |BP180 |BPAG2 |FLJ60881 |KIAA0204 |lad-1 | 胶原蛋白,第XVII型,Alpha 1 | - | HPRD,Biogrid | 11739652 |
GSN | DKFZP313L0718 | 凝胶素(淀粉样变性,芬兰类型) | - | HPRD,Biogrid | 11733011 |
ITGB1 | CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab | 整合素,β1(纤连蛋白受体,β多肽,抗原CD29包括MDF2,MSK12) | - | HPRD | 2116421 |
LRRC7 | DKFZP686I1147 |KIAA1365 |MGC144918 | 含亮氨酸丰富的重复含有7 | - | HPRD | 11160423 |
LRRC7 | DKFZP686I1147 |KIAA1365 |MGC144918 | 含亮氨酸丰富的重复含有7 | LRRC7(Densin-180) interacts with ACTN4 (alpha-Actinin 4). This interaction was modeled on a demonstrated interaction between rat LRCC7 and human ACTN4. | 绑定 | 11160423 |
magi1 | AIP3 | BAIAP1 | BAP1 | MAGI-1 | TNRC19 | WWP3 | 膜相关的鸟苷酸激酶,WW和PDZ结构域,含有1个 | - | HPRD,Biogrid | 12042308 |
myoz1 | CS-2 |Fatz |Myoz | myozenin 1 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
myoz2 | C4orf5 |CS-1 | myozenin 2 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
鼻 | DKFZP686C1456 |FLJ11505 |FLJ36536 |FLJ39568 |FLJ39584 |NEB177D |NEM2 | 树星 | - | HPRD | 11882289 |
NOS2 | hep-nos |iNos |nos |NOS2A | 一氧化氮合酶2,可诱导 | - | HPRD | 12960352 |
PDLIM1 | 攀登1 |CLP-36 |clp36 |HCLIM1 | PDZ和LIM域1 | - | HPRD,Biogrid | 10753915 |
PDLIM1 | 攀登1 |CLP-36 |clp36 |HCLIM1 | PDZ和LIM域1 | CLP-36 interacts with alpha-actinin 4. | 绑定 | 10753915 |
SLC9A3R2 | e3karp |MGC104639 |NHE3RF2 |nherf-2 |nherf2 |OCTS2 |SIP-1 |SIP1 |TKA-1 | 溶质载体家族9(钠/氢交换器),成员3调节剂2 | - | HPRD,Biogrid | 11948184 |
trim3 | BERP | FLJ16135 | HAC1 | RNF22 | RNF97 | tripartite motif-containing 3 | - | HPRD,Biogrid | 10673389 |
USP6NL | KIAA0019 |rntre |tre2nl | USP6 n末端 | - | HPRD,Biogrid | 15152255 |