概括
基因 810
象征 calml3
同义词 Clp
描述 像3一样钙调蛋白
参考 MIM:114184|HGNC:HGNC:1452|HPRD:00244|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p15.1
Pascal P值 0.746
胎儿β -0.631
DMG 1(#研究)
支持 细胞内信号转导
5-羟色胺

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07706776 10 5568004 calml3 2.497E-4 0.553 0.037 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C9orf41 0.83 0.84
DGKE 0.83 0.86
mtpn 0.82 0.88
Homer1 0.82 0.85
ptplb 0.81 0.84
C9orf4 0.81 0.82
CDC40 0.80 0.82
Prkacb 0.80 0.86
UBR3 0.80 0.83
C10orf46 0.79 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL139819.3 -0.52 -0.56
Rab34 -0.52 -0.58
FXYD1 -0.50 -0.51
AP002478.3 -0.50 -0.55
EIF4EBP3 -0.49 -0.54
AF347015.21 -0.49 -0.46
higd1b -0.48 -0.50
TLCD1 -0.48 -0.49
GSDMD -0.48 -0.55
EFEMP2 -0.47 -0.50

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 76 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg卵母细胞减数分裂 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg长期增强 70 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg嗅觉转导 389 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg黑色素发生 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg神经胶质瘤 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤预后 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN 87 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HANN对BCL2抑制剂DN的抗性 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matthews皮肤致癌作用 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAT3的Azare肿瘤转化 121 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因