基因页:calml3
概括?
基因 | 810 |
象征 | calml3 |
同义词 | Clp |
描述 | 像3一样钙调蛋白 |
参考 | MIM:114184|HGNC:HGNC:1452|HPRD:00244| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10p15.1 |
Pascal P值 | 0.746 |
胎儿β | -0.631 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | 细胞内信号转导 5-羟色胺 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07706776 | 10 | 5568004 | calml3 | 2.497E-4 | 0.553 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CALML3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C9orf41 | 0.83 | 0.84 |
DGKE | 0.83 | 0.86 |
mtpn | 0.82 | 0.88 |
Homer1 | 0.82 | 0.85 |
ptplb | 0.81 | 0.84 |
C9orf4 | 0.81 | 0.82 |
CDC40 | 0.80 | 0.82 |
Prkacb | 0.80 | 0.86 |
UBR3 | 0.80 | 0.83 |
C10orf46 | 0.79 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL139819.3 | -0.52 | -0.56 |
Rab34 | -0.52 | -0.58 |
FXYD1 | -0.50 | -0.51 |
AP002478.3 | -0.50 | -0.55 |
EIF4EBP3 | -0.49 | -0.54 |
AF347015.21 | -0.49 | -0.46 |
higd1b | -0.48 | -0.50 |
TLCD1 | -0.48 | -0.49 |
GSDMD | -0.48 | -0.55 |
EFEMP2 | -0.47 | -0.50 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg血管平滑肌收缩 | 115 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg长期增强 | 70 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 | 126 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg嗅觉转导 | 389 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg gnRH信号通路 | 101 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg黑色素发生 | 102 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg神经胶质瘤 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pomeroy髓母细胞瘤预后 | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN | 87 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HANN对BCL2抑制剂DN的抗性 | 48 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matthews皮肤致癌作用 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STAT3的Azare肿瘤转化 | 121 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |