Summary
基因ID 813
象征 卡鲁
同义词 -
描述 钙木素
参考 MIM:603420|HGNC:HGNC:1458|HPRD:04569|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q32.1
Pascal P值 0.095
Sherlock P值 0.104
胎儿β 1.051
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10313005 7 128379566 卡鲁 1.05E-7 -0.005 2.3e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17342476 Chrx 102243644 卡鲁 813 0 反式
RS17342483 Chrx 102250155 卡鲁 813 0.01 反式
RS17342504 Chrx 102272107 卡鲁 813 0 反式
SNP_A-2138851 0 卡鲁 813 0 反式
SNP_A-2059928 0 卡鲁 813 0 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MTMR7 0.82 0.81
Cyld 0.82 0.84
TLK1 0.82 0.82
ACSL3 0.80 0.82
gria4 0.80 0.81
SLC25A40 0.79 0.83
Ptplad1 0.78 0.83
prkar1a 0.78 0.87
CDS2 0.78 0.77
OLFM3 0.78 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.37 -0.36
CSAG1 -0.36 -0.40
EIF4EBP3 -0.35 -0.45
CLEC3B -0.35 -0.45
AC098691.2 -0.35 -0.41
AF347015.2 -0.35 -0.34
AF347015.18 -0.35 -0.39
EMX2 -0.35 -0.56
C1orf61 -0.35 -0.46
AP002478.3 -0.35 -0.42

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌类DN 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常 121 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管 83 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜Kras靶向DN 66 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病DN 121 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈肺癌的生存 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhattacharya胚胎干细胞 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤上的theilgaard中性粒细胞 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP 49 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild HRAS致癌特征 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng环境压力反应 56 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ITO PTTG1靶向 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma dn One hundred. 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bohn原发性免疫缺陷综合症 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga PML Interactome 42 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikhaylova通过VHL DN的氧化应激反应 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAKKER FOXO3 TARGETS DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAT3的Azare肿瘤转化 121 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性B 38 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman Vincristine抗性全部 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF持续 32 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因