基因页:甘
概括?
基因 | 8139 |
象征 | 甘 |
同义词 | gan1 | klhl16 |
描述 | 戈克索宁 |
参考 | MIM:605379|HGNC:HGNC:4137|HPRD:05647| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16q24.1 |
Pascal P值 | 0.485 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.481 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GAN_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12147674|16227972|16303566 |
|
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0008150 | 生物_Process | nd | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005883 | 神经丝 | nas | 神经元,Axon(GO术语级别:11) | - |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roylance乳腺癌16Q复制号码 | 63 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肯尼CTNNB1靶向 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇1 | 125 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 1139 | 1146 | 1A,M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-15/16/195/424/497 | 2425 | 2431 | 1a | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
mir-153 | 400 | 406 | 1a | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 2666 | 2672 | M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-182 | 2434 | 2440 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-196 | 1138 | 1144 | M8 | HSA-MIR-196A | uagguaguucauguugugug |
HSA-MIR-196B | uagguaguucuuguugg | ||||
mir-382 | 1145 | 1151 | 1a | HSA-MIR-382脑 | Gaaguuucgugguggauucg |
mir-448 | 399 | 406 | 1A,M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
mir-503 | 2425 | 2431 | 1a | HSA-MIR-503 | uagcagcgggaacaguucugcag |
mir-505 | 181 | 187 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |
HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc | ||||
mir-544 | 2358 | 2365 | 1A,M8 | HSA-MIR-544 | auucugcauuuuuuagcaagu |
mir-96 | 2433 | 2440 | 1A,M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |