基因页面:某种CAMK4
总结吗?
| GeneID | 814年 |
| 象征 | 某种CAMK4 |
| 同义词 | 第四CaMK IV | CaMK-GR | | CaMK |
| 描述 | 钙/第四calmodulin-dependent蛋白激酶 |
| 参考 | MIM: 114080|HGNC: HGNC: 1464|HPRD: 07169| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5 q21.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.197 |
| 这样假定值 | 0.011 |
| 胎儿β | -0.54 |
| eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | 细胞内信号转导 5 -羟色胺 CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Xu_2012 | 全外显子组测序分析 | 新创4基因的突变的外显子组测序鉴定了795个样本 | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 某种CAMK4 | chr5 | 110818516 | C | T | NM_001744 | p.288R > W | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Xu_2012 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16869851 | chr4 | 20690056 | 某种CAMK4 | 814年 | 0.15 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC45A4 | 0.86 | 0.80 |
| KCNC1 | 0.85 | 0.81 |
| PIP4K2C | 0.85 | 0.84 |
| KIAA0513 | 0.84 | 0.84 |
| STAC2 | 0.84 | 0.66 |
| MPP1 | 0.84 | 0.72 |
| t形十字章 | 0.83 | 0.83 |
| NCKIPSD | 0.83 | 0.75 |
| KCNC3 | 0.83 | 0.74 |
| RNF157 | 0.82 | 0.79 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| IL32 | -0.42 | -0.44 |
| AF347015.21 | -0.41 | -0.37 |
| DBI | -0.41 | -0.49 |
| GNG11 | -0.40 | -0.45 |
| APOC1 | -0.39 | -0.40 |
| C1orf61 | -0.39 | -0.48 |
| C16orf74 | -0.39 | -0.40 |
| FAM159B | -0.39 | -0.55 |
| CLEC3B | -0.39 | -0.47 |
| GPR39 | -0.38 | -0.45 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005516 | 钙调蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004683 | calmodulin-dependent蛋白激酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016563 | 转录激活活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007270 | nerve-nerve突触传递 | 国际能源机构 | 神经元,Synap(术语层面:7) | - - - - - - |
| 去:0006468 | 蛋白质磷酸化氨基酸 | 助教 | 8089075 | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 8089075 | |
| 去:0006913 | 核质运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG钙信号通路 | 178年 | 134年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG长期势差现象 | 70年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG生成信号通路 | 126年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA CACAM通路 | 16 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA NFAT通路 | 56 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA PGC1A通路 | 26 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA STATHMIN通路 | 19 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID HDAC CLASSII通路 | 34 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID NFAT 3通路 | 54 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PIDβ连环蛋白NUC途径 | 80年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID PI3K PLC TRK通路 | 36 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME信号通过神经生长因子 | 217年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME DAG和IP3信号 | 32 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由ERBB2 REACTOME信号 | 101年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME表皮生长因子受体信号的癌症 | 109年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 从质膜通过TRKA REACTOME神经生长因子信号 | 137年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FGFR REACTOME信号的疾病 | 127年 | 88年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 在化学突触REACTOME传输 | 186年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME阿片类信号 | 78年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME CA依赖事件 | 30. | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经递质受体结合和下游传播的突触后细胞 | 137年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME PLCβ介导的事件 | 43 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由PDGF REACTOME信号 | 122年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME下游信号转导 | 95年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME激活谷氨酸NMDA受体在绑定和突触后的事件 | 37 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME NMDA受体激活后的事件 | 33 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME FGFR下游信号激活 | One hundred. | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME磷脂酶C介导的级联 | 54 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由FGFR REACTOME信号 | 112年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| JAATINEN造血干细胞DN | 226年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN GAUSSMANN MLL AF4融合目标 | 90年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE皮肤肿瘤促进剂DN | 185年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE乳头状瘤风险低 | 162年 | 104年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE乳头状瘤风险高 | 147年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE鳞状细胞癌 | 146年 | 104年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日MYCN放大目标 | 92年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时 | 487年 | 286年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆衰老的大脑DN | 153年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1目标了 | 673年 | 430年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯TP53的目标了 | 602年 | 364年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53的目标 | 601年 | 369年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精细胞分化 | 37 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精子 | 114年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BREDEMEYER抹布信号不是通过ATM DN | 57 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FIRESTEIN扩散 | 175年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李最近胸腺移民 | 227年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SERVITJA胰岛HNF1A目标 | 163年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO DN FGFR1在前列腺癌的目标模型 | 308年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 500 | 107年 | 114年 | 1、m8 | hsa - mir - 500 | AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUG |