基因页:polr2m
概括?
基因 | 81488 |
象征 | polr2m |
同义词 | gcom1 | grinl1a | gdown | gdown1 |
描述 | 聚合酶(RNA)II亚基M |
参考 | MIM:606485|HGNC:HGNC:14862|Ensembl:ENSG00000255529|HPRD:07575|Vega:Otthumg00000166486 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q21.3 |
Pascal P值 | 0.449 |
Sherlock P值 | 0.565 |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/POLR2M_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KLHL18 | 0.87 | 0.92 |
SLC35C1 | 0.87 | 0.92 |
RUSC2 | 0.87 | 0.91 |
disp2 | 0.86 | 0.89 |
TNPO2 | 0.85 | 0.88 |
Znrf1 | 0.85 | 0.89 |
FAM123C | 0.85 | 0.88 |
ZNF324 | 0.85 | 0.88 |
mapt | 0.84 | 0.90 |
Ambra1 | 0.84 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.76 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.75 |
AF347015.33 | -0.66 | -0.74 |
FXYD1 | -0.66 | -0.73 |
AF347015.27 | -0.65 | -0.74 |
AC021016.1 | -0.65 | -0.76 |
AF347015.8 | -0.65 | -0.76 |
mt-cyb | -0.64 | -0.73 |
S100B | -0.64 | -0.72 |
COPZ2 | -0.63 | -0.70 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ankhd1 | 面具|vbarp | Ankyrin重复和包含1的KH结构域 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
apod | - | 载脂蛋白d | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
CEBPG | gpe1bp |IG/EBP-1 | CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),伽马 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
DGKZ | dagk5 |dagk6 |dgk-zeta |HDGKZETA | 二酰基甘油激酶,Zeta 104KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
阿拉夫 | ahsp |EDRF | 红细胞相关因素 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
higd1b | Clst11240 |CLST11240-15 | HIG1域家庭,成员1B | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
KIAA1377 | - | KIAA1377 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
myo3a | DFNB30 | 肌球蛋白IIIA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
myo9a | FLJ11061 |FLJ13244 |MGC71859 | 肌球蛋白IXA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
PSMC2 | MGC3004 |MSS1 |NBLA10058 |S7 | 蛋白酶体(Prosome,大蛋白)26S亚基,ATPase,2 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
RBM4B | MGC10871 |RBM30 |RBM4L |ZCCHC15 |ZCRB3B | RNA结合基序蛋白4B | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
RPL7A | Surf3 |trup | 核糖体蛋白L7A | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SCMH1 | SCML3 | 性梳子上的Midleg同源1(果蝇) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
thap1 | FLJ10477 |MGC33014 | 包含凋亡相关蛋白1的Thap结构域1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
UQCRQ | QCR8 |QP-C |QPC | 泛醇 - 卵形色素C还原酶,复合体III亚基VII,9.5KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
WDR89 | C14orf150 |MGC9907 |MSTP050 | WD重复域89 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
ZNF410 | APA-1 |APA1 | 锌指蛋白410 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Castellano Hras和NRAS靶向DN | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wendt粘蛋白靶向 | 33 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |