基因页面:PTDSS2
总结吗?
GeneID | 81490年 |
象征 | PTDSS2 |
同义词 | PSS2 |
描述 | 磷脂酰丝氨酸合酶2 |
参考 | MIM: 612793|HGNC: HGNC: 15463|运用:ENSG00000174915|HPRD: 17927|织女:OTTHUMG00000119087 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 11 p15.5 |
帕斯卡假定值 | 0.097 |
夏洛克假定值 | 0.989 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑半球 小脑 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg23260799 | 11 | 451101年 | PTDSS2 | 1.5平台以及 | -0.014 | 5 e - | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PTDSS2_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CHST6 | 0.77 | 0.76 |
SASH1 | 0.77 | 0.77 |
OTUD7B | 0.76 | 0.80 |
AC022100.1 | 0.75 | 0.77 |
PRIMA1 | 0.75 | 0.74 |
PLEKHH1 | 0.74 | 0.75 |
PRR5L | 0.74 | 0.76 |
ITPKB | 0.73 | 0.76 |
KIF13B | 0.73 | 0.77 |
MYOM1 | 0.73 | 0.74 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
COMMD3 | -0.42 | -0.50 |
NR2C2AP | -0.41 | -0.49 |
RPL31 | -0.41 | -0.60 |
RPL27 | -0.40 | -0.61 |
RPL35 | -0.40 | -0.58 |
ZNF32 | -0.40 | -0.53 |
RPS7 | -0.40 | -0.54 |
RPL24 | -0.39 | -0.59 |
RPS23 | -0.39 | -0.56 |
RPS3AP47 | -0.39 | -0.56 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG GLYCEROPHOSPHOLIPID新陈代谢 | 77年 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME磷脂代谢 | 198年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GLYCEROPHOSPHOLIPID生物合成 | 82年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1单核细胞融合 | 204年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃成熟造血细胞 | 293年 | 160年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
研究包括 | 420年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT核心少突细胞分化 | 40 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANOEVELEN肌发生SIN3A目标 | 220年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |