基因页:rsph6a
概括?
基因 | 81492 |
象征 | rsph6a |
同义词 | rshl1 | rsp4 | rsp6 | rsph4b |
描述 | Radial Spake Head 6同源物A(衣原体) |
参考 | MIM:607548|HGNC:HGNC:14241|ENSEMBL:ENSG00000104941|HPRD:09611|Vega:Otthumg00000182482 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.3 |
Pascal P值 | 0.217 |
胎儿β | -0.128 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG17929770 | 19 | 46318514 | rsph6a | 5.73E-5 | 0.381 | 0.022 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RSPH6A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CCDC84 | 0.56 | 0.46 |
NPEPL1 | 0.55 | 0.47 |
ZNF692 | 0.55 | 0.46 |
leng8 | 0.55 | 0.46 |
GDPD3 | 0.54 | 0.44 |
TSSK3 | 0.54 | 0.44 |
Ager | 0.54 | 0.45 |
TNFRSF25 | 0.53 | 0.45 |
Pilrb | 0.53 | 0.46 |
Neil1 | 0.53 | 0.45 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CYCS | -0.37 | -0.40 |
arl1 | -0.37 | -0.41 |
猪 | -0.35 | -0.39 |
DNAJB9 | -0.35 | -0.42 |
TPMT | -0.35 | -0.39 |
DNAJB14 | -0.34 | -0.37 |
IDH3A | -0.34 | -0.37 |
GHITM | -0.34 | -0.38 |
CCDC25 | -0.34 | -0.33 |
OSGIN2 | -0.33 | -0.38 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008199 | 铁铁结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006826 | 铁离子运输 | IEA | - | |
去:0006879 | 细胞铁离子稳态 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005622 | 细胞内 | 艾达 | 11256614 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |