概括
基因 81492
象征 rsph6a
同义词 rshl1 | rsp4 | rsp6 | rsph4b
描述 Radial Spake Head 6同源物A(衣原体)
参考 MIM:607548|HGNC:HGNC:14241|ENSEMBL:ENSG00000104941|HPRD:09611|Vega:Otthumg00000182482
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.3
Pascal P值 0.217
胎儿β -0.128
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG17929770 19 46318514 rsph6a 5.73E-5 0.381 0.022 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CCDC84 0.56 0.46
NPEPL1 0.55 0.47
ZNF692 0.55 0.46
leng8 0.55 0.46
GDPD3 0.54 0.44
TSSK3 0.54 0.44
Ager 0.54 0.45
TNFRSF25 0.53 0.45
Pilrb 0.53 0.46
Neil1 0.53 0.45
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CYCS -0.37 -0.40
arl1 -0.37 -0.41
-0.35 -0.39
DNAJB9 -0.35 -0.42
TPMT -0.35 -0.39
DNAJB14 -0.34 -0.37
IDH3A -0.34 -0.37
GHITM -0.34 -0.38
CCDC25 -0.34 -0.33
OSGIN2 -0.33 -0.38

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008199 铁铁结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006826 铁离子运输 IEA -
去:0006879 细胞铁离子稳态 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005622 细胞内 艾达 11256614

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因