基因页：CAMK2A

概括？
基因 815
象征 CAMK2A
同义词 卡姆卡
描述 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα
参考 MIM：114078|HGNC：HGNC：1460|ENSEMBL：ENSG00000070808|HPRD：06532|Vega：Otthumg00000134281
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q32
Pascal P值 0.321
Sherlock P值 0.533
DMG 1（＃研究）
主持人 元
支持 细胞内信号转导
5-羟色胺
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_CLATHRIN
g2cdb.human_pocklingtonh1
g2cdb.human_synaptosom
G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核
G2CDB.HUMANNRC
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0032
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00459
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.1782

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG07622079 5 149658453 CAMK2A 5.948e-4 0.452 0.05 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CCT8 0.95 0.94
ARMCX1 0.94 0.94
ASNSD1 0.94 0.95
zufsp 0.94 0.94
MRPL44 0.94 0.95
TCP1 0.93 0.92
TSG101 0.93 0.93
CCT6A 0.93 0.92
IGBP1 0.93 0.93
CCT4 0.93 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.77 -0.86
AF347015.33 -0.77 -0.86
AF347015.27 -0.76 -0.86
mt-cyb -0.76 -0.87
AF347015.8 -0.76 -0.87
AF347015.15 -0.75 -0.87
AF347015.31 -0.74 -0.83
AF347015.26 -0.73 -0.88
HLA-F -0.73 -0.81
AF347015.2 -0.73 -0.86

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0005516 钙调蛋白结合 IEA -
去：0005524 ATP结合 我知道了 17052756
去：0005524 ATP结合 IEA -
去：0004683 钙调蛋白依赖性蛋白激酶活性 IEA -
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 艾达 17052756
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去：0051092 NF-kappab转录因子活性的正调控 小鬼 17052756
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0045202 突触 IEA 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） -
去：0005954 钙和钙调蛋白依赖性蛋白激酶复合物 塔斯 11264466
去：0005886 质膜 IEA -
GO：0030054 细胞连接 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ACTN4 肌动蛋白4 |DKFZP686K23158 |FSGS |FSGS1 肌动蛋白，α4 CAMK2A（CAMKII-ALPHA）与ACTN4相互作用（α-肌动蛋白4）。 绑定 11160423
ACTN4 肌动蛋白4 |DKFZP686K23158 |FSGS |FSGS1 肌动蛋白，α4 两个杂交 Biogrid 11160423
ATF1 ews-atf1 |FUS/ATF-1 |Treb36 激活转录因子1 生化活动 Biogrid 8663317
CALM3 PHKD |PHKD3 钙调蛋白3（磷酸化酶激酶，三角洲） 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
CAMK2B CAM2 |camk2 |CAMKB |MGC29528 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIβ 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
CAMK2D camkd |DKFZP686G23119 |DKFZP686I2288 |MGC44911 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶II三角洲 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
CAMK2N2 CAM-KIIN |Camkiin 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶II抑制剂2 - HPRD 9724800
CDK5R1 CDK5P35 |CDK5R |MGC33831 |NCK5A |p23 |P25 |p35 |p35nck5a 细胞周期蛋白依赖性激酶5，调节亚基1（p35） - HPRD，Biogrid 12223541
CHMP5 c9orf83 |CGI-34 |HSPC177 |PNAS-2 |SNF7DC2 染色质修饰蛋白5 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
CREB1 Creb |MGC9284 cAMP响应元件结合蛋白1 生化活动 Biogrid 8663317
DAPK2 DRP-1 |MGC119312 死亡相关蛋白激酶2 - HPRD 10629061
DLG1 DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG 圆盘，大型同源物1（果蝇） - HPRD，Biogrid 12933808
DLG3 KIAA1232 |MRX |MRX90 |NE-DLG |nedlg |SAP102 圆盘，大型同源物3（果蝇神经内分泌-DLG，果蝇） 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
grin1 NMDA1 |NMDAR1 |NR1 谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸1 - HPRD 10862698
grin2b MGC142178 |MGC142180 |NMDAR2B |NR2B |HNR3 谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸2B - HPRD，Biogrid 11459059
itpka IP3KA 肌醇1,4,5-三磷酸3-激酶A - HPRD，Biogrid 11468283
LRRC7 DKFZP686I1147 |KIAA1365 |MGC144918 含亮氨酸丰富的重复含有7 - HPRD 11160423
LRRC7 DKFZP686I1147 |KIAA1365 |MGC144918 含亮氨酸丰富的重复含有7 LRRC7（Densin-180）与CAMK2A（CAMKII-ALPHA）相互作用。这种相互作用是建立在大鼠LRCC7和人CAMK2A之间的相互作用上的模型。 绑定 11160423
park2 AR-JP |LPRS2 |PDJ |prkn 帕金森病（常染色体隐性，少年）2，帕金 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11679592
RIMS1 cord7 |KIAA0340 |MGC167823 |MGC176677 |rab3ip2 |边缘|RIM1 调节突触膜胞吐作用1 生化活动 Biogrid 12871946
syngap1 DKFZP761G1421 |KIAA1938 |rasa1 |rasa5 |syngap 突触Ras GTPase激活蛋白1同源物（大鼠） - HPRD 11278737|12951199
tanc1 KIAA1728 |ROLSB |田 四肽重复，arnkyrin重复和包含1 - HPRD 15673434


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg erbb信号通路 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg卵母细胞减数分裂 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg wnt信号通路 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg长期增强 70 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg嗅觉转导 389 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg黑色素发生 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg神经胶质瘤 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡丁生物肽途径 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Cacam途径 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta PGC1A途径 26 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Stathmin Pathway 19 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Creb途径 27 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Wnt Ca2环状GMP途径 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid wnt非规范途径 32 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Netrin途径 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IFNG途径 40 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3K PLC TRK途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FGF途径 55 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TGFBR途径 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMPA受体的Reactome贩运 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RAS激活UOPN CA2通过NMDA受体Infux 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NMDA受体在谷氨酸结合和突触后事件上的反应组激活 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Creb通过RAS激活的磷酸化 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组后NMDA受体激活事件 33 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NMDA受体谷氨酸结合和激活的反应组释放 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Creb通过CAMKII的激活来磷酸化 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素伽马信号传导 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标8WK 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung可卡因奖励4WK 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein神经元标记 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein位于远端和近端树突 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POS组胺反应网络 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES HCP与H3未甲基化 63 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 228 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 220 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-142-5p 1499年 1506 1A，M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-148/152 1479年 1485 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-26 3100 3106 1a HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-27 3094 3100 1a HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-331 2732 2738 1a HSA-MIR-331脑 gccccugggccuauccuagaa
mir-338 88 94 1a HSA-MIR-338脑 uccagauuuuuguuga
mir-495 3024 3030 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu