概括
基因 81537
象征 SGPP1
同义词 sppase1
描述 鞘氨醇1-磷酸磷酸酶1
参考 MIM:612826|HGNC:HGNC:17720|ENSEMBL:ENSG00000126821|HPRD:10226|Vega:Otthumg0000000029080
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q23.2
Pascal P值 0.387
胎儿β -0.846
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17799628 Chr9 106442995 SGPP1 81537 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
rsph1 0.90 0.61
WDR16 0.89 0.69
RP11-282K6.1 0.89 0.61
dnah9 0.88 0.73
C2orf39 0.88 0.62
WDR69 0.88 0.68
C15orf26 0.88 0.48
C1orf192 0.88 0.63
TCTEX1D1 0.87 0.60
C3ORF25 0.87 0.59
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.2 -0.18 -0.11
AF347015.18 -0.18 -0.13
AC135724.1 -0.17 -0.30
Scube1 -0.17 -0.23
PLA2G5 -0.17 -0.10
Dact1 -0.17 0.06
anp32c -0.17 -0.26
SLA -0.17 0.11
Bach2 -0.16 0.05
AF347015.21 -0.16 -0.07

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg鞘脂代谢 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P META途径 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome鞘脂从头生物合成 31 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组鞘脂代谢 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
grabarczyk bcl11b目标dn 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王攀登目标 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标 148 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wotton Runx目标DN 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞向上 90 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir133靶向 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因