基因页：SLC38A1

概括？
基因 81539
象征 SLC38A1
同义词 ata1 | nat2 | sat1 | snat1
描述 Solute Carrier家族38成员1
参考 MIM：608490|HGNC：HGNC：13447|ENSEMBL：ENSG00000111371|HPRD：12245|Vega：Otthumg00000169470
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q13.11
Pascal P值 0.024
Sherlock P值 0.007
胎儿β 1.138
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1492890 CHR12 46600616 SLC38A1 81539 0 顺式
RS1492890 CHR12 46600616 SLC38A1 81539 0.14 反式
RS4985090 CHR16 8735580 SLC38A1 81539 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC110491.1 0.74 0.72
ATP11A 0.74 0.74
CLN8 0.73 0.70
SPTLC2 0.73 0.75
RASSF8 0.73 0.72
galnt7 0.72 0.73
TJP1 0.72 0.69
Stat3 0.72 0.76
Swap70 0.71 0.69
RNF141 0.71 0.67
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf61 -0.37 -0.43
IL32 -0.36 -0.35
AF347015.21 -0.35 -0.29
ST20 -0.32 -0.35
Plac9 -0.32 -0.29
RPL35 -0.32 -0.38
AC044839.2 -0.32 -0.31
RPL31 -0.31 -0.37
C1orf54 -0.31 -0.31
PFDN5 -0.31 -0.34

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005283 钠：氨基酸分类蛋白活性 nas 谷氨酸（GO期限：10） 10891391
GO：0015293 分类者活动 IEA -
GO：0015175 中性氨基酸跨膜转运蛋白活性 nas 10891391
GO：0031402 钠离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015804 中性氨基酸转运 nas 10891391
去：0006814 钠离子运输 IEA -
去：0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016021 膜不可或缺 nas 10891391
去：0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸跨质膜的转运 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VMYB vs CMYB DN的LIU目标 43 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纽曼ERCC6靶向 26 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoebeke淋巴干细胞向上 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞DN的TONKS目标 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯蒂宫颈癌增殖簇 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标 148 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与CBFB MYH11融合 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 73 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼抵抗DN 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC靶向DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集1 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集11 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G23 UP 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类多肌膜7 DN 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特（Nielsen Gist） 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
绅士白血病干细胞 29 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-153 4917 4923 M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-23 5891 5898 1A，M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-30-5p 85 91 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-323 5891 5897 1a HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-381 434 440 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu