基因页面:GDPD5
总结吗?
| GeneID | 81544年 |
| 象征 | GDPD5 |
| 同义词 | GDE2 | PP1665 |
| 描述 | glycerophosphodiester包含5磷酸二酯酶域 |
| 参考 | MIM: 609632|HGNC: HGNC: 28804|运用:ENSG00000158555|HPRD: 15159|织女:OTTHUMG00000165484 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q13.4-q13.5 |
| 帕斯卡假定值 | 0.312 |
| 夏洛克假定值 | 0.754 |
| 胎儿β | 0.39 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GDPD5 | chr11 | 75152811 | C | T | NM_030792 | p.402R >问 | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg24212471 | 11 | 75180067 | GDPD5 | 3.835的军医 | 0.435 | 0.043 | DMG: Wockner_2014 |
| cg01374565 | 11 | 75236762 | GDPD5 | 5.688的军医 | -0.21 | 0.049 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs828895 | chr2 | 74339309 | GDPD5 | 81544年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs16829545 | chr2 | 151977407 | GDPD5 | 81544年 | 4.41的军医 | 反式 | ||
| rs3845734 | chr2 | 171125572 | GDPD5 | 81544年 | 1.696的军医 | 反式 | ||
| rs7584986 | chr2 | 184111432 | GDPD5 | 81544年 | 9.006 e - | 反式 | ||
| rs2183142 | chr4 | 159232695 | GDPD5 | 81544年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs1929780 | chr6 | 40757438 | GDPD5 | 81544年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs1929769 | chr6 | 40765977 | GDPD5 | 81544年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs16922210 | chr9 | 105594398 | GDPD5 | 81544年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs3853290 | chr10 | 708359年 | GDPD5 | 81544年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs11253324 | chr10 | 743835年 | GDPD5 | 81544年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs16955618 | chr15 | 29937543 | GDPD5 | 81544年 | 1.143 e-11 | 反式 | ||
| rs16978352 | chr18 | 42944875 | GDPD5 | 81544年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs1507467 | chr18 | 73755746 | GDPD5 | 81544年 | 0.13 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF385A | 0.66 | 0.70 |
| C1QTNF1 | 0.66 | 0.63 |
| AIFM3 | 0.65 | 0.61 |
| ANGPTL4 | 0.61 | 0.61 |
| UBTD1 | 0.61 | 0.64 |
| FAM151A | 0.60 | 0.63 |
| ALDH4A1 | 0.60 | 0.63 |
| SCARA3 | 0.60 | 0.66 |
| ZBTB7B | 0.60 | 0.64 |
| AL132868.3 | 0.59 | 0.57 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RTDR1 | -0.52 | -0.61 |
| STMN1 | -0.51 | -0.58 |
| EXOC6 | -0.51 | -0.56 |
| PVRL3 | -0.51 | -0.58 |
| FRG1 | -0.51 | -0.56 |
| NPY5R | -0.50 | -0.59 |
| SNRPB2 | -0.50 | -0.58 |
| CYP2R1 | -0.50 | -0.56 |
| SYT4 | -0.50 | -0.59 |
| ZNF642 | -0.50 | -0.54 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合粒细胞DN | 17 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN UDAYAKUMAR MED1目标 | 240年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SENESE HDAC3目标 | 536年 | 332年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOZGIT ESR1目标了 | 149年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MORI小PRE BII淋巴细胞 | 86年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MORI不成熟的B淋巴细胞 | 53 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌11 q12 Q14扩增子 | 158年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 苔星体信号转导 | 59 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BAELDE糖尿病肾病了 | 86年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 恩格尔曼氏癌症祖细胞了 | 48 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 霍夫曼大变小前BII淋巴细胞DN | 72年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞DN | 50 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 森古普塔EBNA1 ANTICORRELATED | 173年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李诱导T自然杀伤 | 307年 | 182年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KATSANOU ELAVL1目标了 | 169年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 德拉克洛瓦RARG绑定MEF | 367年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |