基因页:VOPP1
概括?
基因 | 81552 |
象征 | VOPP1 |
同义词 | ecop |喘不过气来 |
描述 | 囊泡,过表达癌症,生存蛋白1 |
参考 | MIM:611915|HGNC:HGNC:34518|ENSEMBL:ENSG00000154978|HPRD:08526|Vega:Otthumg00000156124 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p11.2 |
Pascal P值 | 0.022 |
DEG P值 | DEG:Maycox_2009:CC_BA10_FOLD_CHANGE = -1.11:CC_BA10_DISEASE_P = 0.0018:HBB_BA9_FOLD_CHANGE = -1.06:HBB_BA9_DISEASE_P = 0.0484 |
胎儿β | -0.271 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/VOPP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TFAM | 0.93 | 0.92 |
ZNF644 | 0.93 | 0.90 |
SIRT1 | 0.93 | 0.90 |
RNF219 | 0.92 | 0.91 |
CEP57 | 0.92 | 0.92 |
ZNF678 | 0.92 | 0.90 |
ZNF681 | 0.92 | 0.91 |
ZNF675 | 0.92 | 0.93 |
Smarcad1 | 0.92 | 0.91 |
G2E3 | 0.92 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.69 | -0.78 |
AIFM3 | -0.68 | -0.78 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.86 |
AF347015.33 | -0.67 | -0.84 |
AF347015.31 | -0.66 | -0.83 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.82 |
mt-cyb | -0.66 | -0.84 |
FXYD1 | -0.66 | -0.84 |
S100B | -0.66 | -0.80 |
C5orf53 | -0.65 | -0.71 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与小叶正常 | 73 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dirmeier LMP1响应迟到 | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
戈德拉斯体内平衡增殖 | 171 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ROSS AML与AML1 ETO融合 | 76 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C DN | 59 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集13 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bakker FOXO3靶向 | 61 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔内成熟 | 116 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |