概括
基因 81552
象征 VOPP1
同义词 ecop |喘不过气来
描述 囊泡,过表达癌症,生存蛋白1
参考 MIM:611915|HGNC:HGNC:34518|ENSEMBL:ENSG00000154978|HPRD:08526|Vega:Otthumg00000156124
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p11.2
Pascal P值 0.022
DEG P值 DEG:Maycox_2009:CC_BA10_FOLD_CHANGE = -1.11:CC_BA10_DISEASE_P = 0.0018:HBB_BA9_FOLD_CHANGE = -1.06:HBB_BA9_DISEASE_P = 0.0484
胎儿β -0.271

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Maycox_2009 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TFAM 0.93 0.92
ZNF644 0.93 0.90
SIRT1 0.93 0.90
RNF219 0.92 0.91
CEP57 0.92 0.92
ZNF678 0.92 0.90
ZNF681 0.92 0.91
ZNF675 0.92 0.93
Smarcad1 0.92 0.91
G2E3 0.92 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.69 -0.78
AIFM3 -0.68 -0.78
MT-CO2 -0.67 -0.86
AF347015.33 -0.67 -0.84
AF347015.31 -0.66 -0.83
AF347015.27 -0.66 -0.82
mt-cyb -0.66 -0.84
FXYD1 -0.66 -0.84
S100B -0.66 -0.80
C5orf53 -0.65 -0.71

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与小叶正常 73 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dirmeier LMP1响应迟到 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSS AML与AML1 ETO融合 76 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C DN 59 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集13 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向 61 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟 116 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因