基因页面:LMAN2L
总结吗?
| GeneID | 81562年 |
| 象征 | LMAN2L |
| 同义词 | VIPL |
| 描述 | 植物血凝素、甘露糖结合2 |
| 参考 | MIM: 609552|HGNC: HGNC: 19263|运用:ENSG00000114988|HPRD: 17286|织女:OTTHUMG00000130453 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q11.2 |
| 帕斯卡假定值 | 7.994的军医 |
| 夏洛克假定值 | 0.987 |
| 胎儿β | 0.649 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0004 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg01990225 | 2 | 97406019 | LMAN2L | -0.025 | 0.31 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2167919 | chr2 | 12342524 | LMAN2L | 81562年 | 0.14 | 反式 | ||
| rs7706288 | chr5 | 141864248 | LMAN2L | 81562年 | 0.18 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005529 | 糖绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005537 | 甘露糖结合 | 助教 | 12609988 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006457 | 蛋白质折叠 | NAS | 12609988 | |
| 去:0006888 | ER高尔基vesicle-mediated运输 | 助教 | 12878160 | |
| 去:0015031 | 蛋白质的运输 | 小鬼 | 12878160 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000139 | 高尔基体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 12878160 | |
| 去:0005789 | 内质网的膜 | 艾达 | 12609988 | |
| 去:0005783 | 内质网 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 助教 | 12609988 | |
| 去:0030134 | ER高尔基运输囊泡 | NAS | 12878160 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移了 | 344年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 丰田MIR34B和MIR34C的目标 | 463年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李诱导T自然杀伤DN | 116年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍持续时间CORR DN | 146年 | 90年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 124.1 | 1172年 | 1178年 | m8 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| miR-124/506 | 1172年 | 1178年 | 1 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| miR-15/16/195/424/497 | 1196年 | 1202年 | m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| miR-34/449 | 1169年 | 1175年 | m8 | hsa-miR-34a大脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
| hsa-miR-34c | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
| hsa - mir - 449 | UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU | ||||
| hsa - mir - 449 b | AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC | ||||
| miR-34b | 1170年 | 1176年 | m8 | hsa-miR-34b | UAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUG |