基因页面:SNX27
总结吗?
| GeneID | 81609年 |
| 象征 | SNX27 |
| 同义词 | MRT1 | MY014 |
| 描述 | 排序nexin家庭成员27 |
| 参考 | MIM: 611541|HGNC: HGNC: 20073|运用:ENSG00000143376|HPRD: 11591|织女:OTTHUMG00000013052 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 q21.3 |
| 夏洛克假定值 | 0.1 |
| 胎儿β | 0.173 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑 皮质 |
| 支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00814 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg16269755 | 1 | 151586058 | SNX27 | 2.885的军医 | 0.337 | 0.039 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0035091 | 磷酸肌醇绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0015031 | 蛋白质的运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005769 | 早期内体 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CHARAFE乳腺癌导管和基地 | 380年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOHANKUMAR TLX1目标了 | 414年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢泼德BMYB吗啉代了 | 205年 | 126年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒18人力资源 | 178年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| POS组胺反应 | 13 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ICHIBA移植物抗宿主病D7 DN | 40 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HG TERAO AOX4目标 | 28 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 皮德森转移由ERBB2同种型7 | 403年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-130/301 | 1166年 | 1172年 | m8 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
| hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
| hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
| miR-141/200a | 4070年 | 4076年 | m8 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
| mir - 145 | 1141年 | 1148年 | 1、m8 | hsa - mir - 145 | GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU |
| miR-148/152 | 1167年 | 1173年 | m8 | hsa - mir - 148 a | UCAGUGCACUACAGAACUUUGU |
| hsa - mir - 152大脑 | UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG | ||||
| hsa - mir - 148 b | UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU | ||||
| mir - 183 | 1483年 | 1489年 | 1 | hsa - mir - 183 | UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG |
| mir - 186 | 5446年 | 5452年 | m8 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
| miR-19 | 1165年 | 1171年 | m8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
| hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir - 205 | 1403年 | 1410年 | 1、m8 | hsa - mir - 205 | UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG |
| mir - 217 | 5290年 | 5296年 | 1 | hsa - mir - 217 | UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU |
| miR-23 | 5325年 | 5332年 | 1、m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-28 | 4706年 | 4712年 | 1 | hsa-miR-28大脑 | AAGGAGCUCACAGUCUAUUGAG |
| miR-30-5p | 1419年 | 1425年 | 1 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir - 323 | 5325年 | 5331年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 376 | 1149年 | 1155年 | 1 | hsa - mir - 376 a | AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU |
| hsa - mir - 376 b | AUCAUAGAGGAAAAUCCAUGUU | ||||
| mir - 409 - 5 - p | 887年 | 893年 | 1 | hsa - mir - 409 - 5 - p | AGGUUACCCGAGCAACUUUGCA |
| mir - 410 | 1204年 | 1210年 | 1 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir - 433 - 3 - p | 1401年 | 1407年 | 1 | hsa - mir - 433大脑 | AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU |
| mir - 496 | 1195年 | 1201年 | 1 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |