基因页:PPP1R14C
概括?
基因 | 81706 |
象征 | PPP1R14C |
同义词 | cpi17 like | kepi | ny-br-81 |
描述 | 蛋白质磷酸酶1调节抑制剂亚基14C |
参考 | MIM:613242|HGNC:HGNC:14952|Ensembl:ENSG00000198729|HPRD:17890|Vega:Otthumg0000000015818 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q24.3-Q25.3 |
Pascal P值 | 0.272 |
Sherlock P值 | 0.045 |
胎儿β | 0.619 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7735200 | CHR5 | 178402406 | PPP1R14C | 81706 | 0.19 | 反式 | ||
RS12570265 | Chr10 | 101668569 | PPP1R14C | 81706 | 0.2 | 反式 | ||
RS7132043 | CHR12 | 80968399 | PPP1R14C | 81706 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPP1R14C_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0004865 | 1型丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白磷酸酶抑制剂活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0042325 | 调节磷酸化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID幼稚园 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边结肠癌MSI与MSS DN | 81 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chathafe乳腺癌基础与间充质 | 121 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克拉斯的iwanaga致癌作用 | 170 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir30目标dn | 27 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-10 | 8 | 14 | M8 | HSA-MIR-10A | uacccuguagauccgaauuugug |
HSA-MIR-10B | uacccuguagaaccgaauuugu | ||||
mir-30-5p | 1481 | 1487 | M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-339 | 339 | 345 | 1a | HSA-MIR-339 | ucccuccuccaggagcuca |