基因页：SPRY4
Summary？
| GeneID | 81848 |
| Symbol | SPRY4 |
| 同义词 | HH17 |
| 描述 | 发芽的RTK信号拮抗剂4 |
| 参考 | MIM:607984|HGNC：HGNC：15533|ENSEMBL：ENSG00000187678|HPRD：10466|Vega：Otthumg00000129663 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5 q31.3 |
| Pascal P值 | 0.056 |
| 胎儿β | -0.275 |
| DMG | 2（＃研究） |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02731554 | 5 | 141694233 | SPRY4 | 4.03e-5 | 0.38 | 0.02 | DMG：Wockner_2014 |
| CG10078074 | 5 | 141736877 | SPRY4 | 7.03E-8 | -0.008 | 1.7e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12027893 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0009966 | 信号转导调节 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| GO：0043407 | MAP激酶活性的负调控 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO:0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon（GO术语级别：4） | - |
| 去：0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-141/200a | 1253 | 1259 | 1a | HSA-MIR-141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa-miR-200a | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| miR-15/16/195/424/497 | 1165 | 1171 | M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
| HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
| HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
| HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
| HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
| HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 2181 | 2187 | M8 | HSA-MIR-17-5P | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
| HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
| HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
| HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| hsa-miR-519d | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
| mir-181 | 2017 | 2024 | 1A，M8 | HSA-MIR-181A脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| HSA-MIR-181A脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU | ||||
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-182 | 876 | 882 | M8 | HSA-MIR-182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| mir-29 | 1418 | 1424 | 1a | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| mir-31 | 1923年 | 1929年 | 1a | HSA-MIR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |
| mir-331 | 1326 | 1332 | M8 | HSA-MIR-331脑 | gccccugggccuauccuagaa |