基因页面:FAHD1
总结吗?
| GeneID | 81889年 |
| 象征 | FAHD1 |
| 同义词 | C16orf36 | YISKL |
| 描述 | fumarylacetoacetate水解酶域包含1 |
| 参考 | MIM: 616320|HGNC: HGNC: 14169|运用:ENSG00000180185|HPRD: 13286|织女:OTTHUMG00000128663 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 16 p13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.009 |
| 夏洛克假定值 | 0.644 |
| eGene | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg06782493 | 16 | 1876874 | HAGH; FAHD1 | 1.97 e-5 | -0.24 | 0.016 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs3848346 | chr16 | 1889820 | FAHD1 | 81889年 | 0.01 | 独联体 | ||
| rs3848348 | chr16 | 1890055 | FAHD1 | 81889年 | 0 | 独联体 | ||
| rs1742419 | chr16 | 1901808 | FAHD1 | 81889年 | 0.11 | 独联体 | ||
| rs1625393 | chr16 | 1901892 | FAHD1 | 81889年 | 0.02 | 独联体 | ||
| rs1657117 | chr16 | 1903650 | FAHD1 | 81889年 | 0.02 | 独联体 | ||
| rs7199384 | chr16 | 1904586 | FAHD1 | 81889年 | 0.05 | 独联体 | ||
| rs453494 | chr16 | 1916102 | FAHD1 | 81889年 | 0.03 | 独联体 | ||
| rs1657094 | chr16 | 1920628 | FAHD1 | 81889年 | 0.01 | 独联体 | ||
| rs1657095 | chr16 | 1920677 | FAHD1 | 81889年 | 0.1 | 独联体 | ||
| rs2917523 | chr16 | 1920739 | FAHD1 | 81889年 | 0 | 独联体 | ||
| rs2974856 | chr16 | 1920756 | FAHD1 | 81889年 | 0.08 | 独联体 | ||
| rs2982235 | chr16 | 1920791 | FAHD1 | 81889年 | 0.02 | 独联体 | ||
| rs911392 | chr16 | 1947258 | FAHD1 | 81889年 | 0.02 | 独联体 | ||
| rs1742464 | chr16 | 1947334 | FAHD1 | 81889年 | 0.03 | 独联体 | ||
| rs2982447 | chr16 | 1947412 | FAHD1 | 81889年 | 0.05 | 独联体 | ||
| rs2917523 | chr16 | 1920739 | FAHD1 | 81889年 | 0.13 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 16 p13 NIKOLSKY乳腺癌扩增子 | 120年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |