基因页:营
概括?
基因 | 820 |
象征 | 营 |
同义词 | CAP-18 | CAP18 |抽筋|秋季39 | Fall39 | HSD26 | LL37 |
描述 | cathelicidin抗菌肽 |
参考 | MIM:600474|HGNC:HGNC:1472|ENSEMBL:ENSG00000164047|HPRD:02722|Vega:Otthumg00000133526 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.3 |
Pascal P值 | 0.009 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04523589 | 3 | 48265146 | 营 | 8.27e-8 | -13.777 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CAMP_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NEK9 | 0.83 | 0.86 |
fubp3 | 0.82 | 0.81 |
GPT2 | 0.78 | 0.78 |
POMT2 | 0.78 | 0.77 |
CTNNA1 | 0.77 | 0.72 |
WASF2 | 0.77 | 0.77 |
USP40 | 0.77 | 0.77 |
RIPK1 | 0.76 | 0.79 |
ikbkb | 0.76 | 0.76 |
ATP10D | 0.76 | 0.76 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.54 | -0.43 |
AL050337.1 | -0.47 | -0.32 |
Sycp3 | -0.47 | -0.35 |
IL32 | -0.46 | -0.39 |
C1orf54 | -0.45 | -0.32 |
clec2b | -0.45 | -0.36 |
Ly96 | -0.43 | -0.36 |
AF347015.31 | -0.43 | -0.37 |
Rergl | -0.42 | -0.40 |
MT-CO2 | -0.42 | -0.36 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PC12细胞中的ST分化途径 | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
st g alpha的路径 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST颗粒细胞存活途径 | 27 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
圣肾上腺素能 | 36 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST PAC1受体途径 | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St Myocyte广告路径 | 27 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组的潜在感染与结核分枝杆菌的智人感染 | 33 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bystroem与IL5 UP相关 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索CD40信号传导DN | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bennett系统性狼疮红斑 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
叶中性粒细胞颗粒成分 | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lian Lipa目标6m | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su睾丸 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lian Lipa目标3M | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成6 | 189 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼中的Smid乳腺癌复发 | 97 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌ERBB2 UP | 147 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vilimas Notch1靶向DN | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病35D UP | 131 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内利未成熟的中性粒细胞 | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
cebpa的valk aml | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kamikubo Myeloid Cebpa网络 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |