概括
基因 820
象征
同义词 CAP-18 | CAP18 |抽筋|秋季39 | Fall39 | HSD26 | LL37
描述 cathelicidin抗菌肽
参考 MIM:600474|HGNC:HGNC:1472|ENSEMBL:ENSG00000164047|HPRD:02722|Vega:Otthumg00000133526
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.3
Pascal P值 0.009
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04523589 3 48265146 8.27e-8 -13.777 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NEK9 0.83 0.86
fubp3 0.82 0.81
GPT2 0.78 0.78
POMT2 0.78 0.77
CTNNA1 0.77 0.72
WASF2 0.77 0.77
USP40 0.77 0.77
RIPK1 0.76 0.79
ikbkb 0.76 0.76
ATP10D 0.76 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.54 -0.43
AL050337.1 -0.47 -0.32
Sycp3 -0.47 -0.35
IL32 -0.46 -0.39
C1orf54 -0.45 -0.32
clec2b -0.45 -0.36
Ly96 -0.43 -0.36
AF347015.31 -0.43 -0.37
Rergl -0.42 -0.40
MT-CO2 -0.42 -0.36

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PC12细胞中的ST分化途径 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
st g alpha的路径 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST颗粒细胞存活途径 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
圣肾上腺素能 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST PAC1受体途径 7 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Myocyte广告路径 27 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组的潜在感染与结核分枝杆菌的智人感染 33 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystroem与IL5 UP相关 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索CD40信号传导DN 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bennett系统性狼疮红斑 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
叶中性粒细胞颗粒成分 25 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lian Lipa目标6m 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su睾丸 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lian Lipa目标3M 59 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vilimas Notch1靶向DN 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内利未成熟的中性粒细胞 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
cebpa的valk aml 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kamikubo Myeloid Cebpa网络 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn 88 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因