基因页面:CANX
总结吗?
| GeneID | 821年 |
| 象征 | CANX |
| 同义词 | CNX | IP90 | P90 |
| 描述 | calnexin |
| 参考 | MIM: 114217|HGNC: HGNC: 1473|运用:ENSG00000127022|HPRD: 00252|织女:OTTHUMG00000130910 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5 q35 |
| 帕斯卡假定值 | 0.105 |
| 夏洛克假定值 | 0.197 |
| 胎儿β | -0.129 |
| eGene | 皮质 元 |
| 支持 | RNA和蛋白质合成 CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Xu_2012 | 全外显子组测序分析 | 新创4基因的突变的外显子组测序鉴定了795个样本 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.0276 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CANX | chr5 | 179136974 | 一个 | G | NM_001024649 NM_001746 |
p.210K > R p.210K > R |
错义 错义 |
精神分裂症 | 认为:Xu_2012 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GJB1 | 0.95 | 0.90 |
| KLK6 | 0.94 | 0.90 |
| SLC5A11 | 0.93 | 0.93 |
| MOG | 0.93 | 0.91 |
| 特遣部队 | 0.92 | 0.92 |
| SLC31A2 | 0.92 | 0.82 |
| PLA2G16 | 0.92 | 0.91 |
| DBNDD2 | 0.92 | 0.90 |
| PPAP2C | 0.91 | 0.85 |
| SGK2 | 0.91 | 0.92 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NKIRAS2 | -0.55 | -0.71 |
| CRMP1 | -0.53 | -0.69 |
| TUBB2B | -0.53 | -0.78 |
| HN1 | -0.52 | -0.71 |
| HMGB3 | -0.52 | -0.72 |
| KIAA1949 | -0.52 | -0.71 |
| TUBB | -0.52 | -0.72 |
| YBX1 | -0.52 | -0.78 |
| PCDHB18 | -0.51 | -0.70 |
| CD24 | -0.51 | -0.71 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005529 | 糖绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 助教 | 8136357 | |
| 去:0051082 | 的蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0051082 | 的蛋白结合 | NAS | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0001525 | 血管生成 | 艾达 | 15467828 | |
| 去:0006457 | 蛋白质折叠 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009306 | 蛋白质分泌 | 助教 | 8055875 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005789 | 内质网的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 15467828 | |
| 去:0005783 | 内质网 | 艾达 | 14966132|15467828 | |
| 去:0005783 | 内质网 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0042470 | 黑素体 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABCC2 | ABC30 | CMOAT | dj | KIAA1010 | MRP2 | cMRP | 磷酸腺苷磁带,sub-family C(雌性生殖道/ MRP),成员2 | - - - - - - | HPRD | 12222674 |
| 飞机观测 | FLDB | 载脂蛋白B(包括Ag) (x)抗原) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 14498830 |
| BCAP31 | 6 c6-ag | BAP31 CDM | | DXS1357E | b细胞receptor-associated蛋白质31 | - - - - - - | HPRD | 11851433 |
| CALR | CRT | FLJ26680 | RO | SSA | cC1qR | calreticulin | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10436013 |
| CD1D | CD1A | MGC34622 | R3 | CD1d分子 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12239218 |
| CD3D | CD3-DELTA | T3D | CD3d分子,δ(CD3-TCR复杂) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8278814|8621641 |
| CD82 | 4 f9 | C33 | GR15 | IA4 | KAI1 R2 | | SAR2 | ST6 | TSPAN27 | CD82分子 | - - - - - - | HPRD | 11350933 |
| 雌性生殖道 | ABC35 | ABCC7 | CF |雌性生殖道/ MRP | MRP7 | TNR-CFTR | dJ760C5.1 | 囊性纤维化跨膜电导调节(磷酸腺苷盒式sub-family C,成员7) | 雌性生殖道与CANX交互。这种交互是仿照人类雌性生殖道和仓鼠CANX证明之间的交互。 | 绑定 | 15105504 |
| 雌性生殖道 | ABC35 | ABCC7 | CF |雌性生殖道/ MRP | MRP7 | TNR-CFTR | dJ760C5.1 | 囊性纤维化跨膜电导调节(磷酸腺苷盒式sub-family C,成员7) | 雌性生殖道与CANX交互。 | 绑定 | 7513695 |
| EBI3 | IL27B | 巴尔病毒诱导3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8551575 |
| EDEM1 | EDEM | FLJ51559 | FLJ51560 | KIAA0212 | 呃降解增强剂,甘露糖苷酶alpha-like 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12610305 |
| F8 | AHF | DXS1253E | F8B | F8C | FVIII | - | 凝血因子促凝血的组件 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9525969 |
| GRIA1 | GLUH1 | GLUR1 | GLURA | HBGR1 | MGC133252 | 谷氨酸受体,ionotropic, AMPA 1 | - - - - - - | HPRD | 10461883 |
| GRIN1 | NMDA1 | NMDAR1 | NR1 | 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 1 | - - - - - - | HPRD | 11506858|14732708 |
| HTR3A | ht3r 5-HT-3 | 5-HT3A | 5-HT3R | 5 | HTR3 | 5 -羟色胺(5 -羟色胺3受体) | - - - - - - | HPRD | 12359150 |
| ITGA6 | CD49f | DKFZp686J01244 | FLJ18737 | ITGA6B | VLA-6 | 整合素α6 | - - - - - - | HPRD | 8163531 |
| ITGB1 | CD29 | FNRB | GPIIA | MDF2 | MSK12 | VLA-BETA相似|方法估算出来的 | 整合素β1(纤连蛋白受体β多肽抗原CD29包括MDF2 MSK12) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8163531 |
| 临床上 | LAC |液体变阻器| LPH1 | 乳糖酶 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11751874 |
| LPA | AK38 | APOA | LP | 脂蛋白,Lp (a) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9717723|12562843 |
| LRP1恰巧 | 4月A2MR | apoe | | CD91 | FLJ16451 | IGFBP3R | |部队MGC88725 | TGFBR5 | 低密度lipoprotein-related蛋白1 (alpha-2-macroglobulin受体) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 14980518 |
| MBTPS1 | KIAA0091 | MGC138711 | MGC138712 | PCSK8 | S1P | SKI-1 | 膜结合转录因子肽酶,站点1 | - - - - - - | HPRD | 11756446 |
| PDIA3 | ER60 | ERp57 | ERp60 | ERp61 | GRP57 | GRP58 | HsT17083 | P58 | PI-PLC | 蛋白二硫化物异构酶家族,成员3 | ERp57与CNX交互。这种交互是模仿狗CNX之间的交互和ERp57从一个未指明的来源。 | 绑定 | 12052826 |
| PDIA3 | ER60 | ERp57 | ERp60 | ERp61 | GRP57 | GRP58 | HsT17083 | P58 | PI-PLC | 蛋白二硫化物异构酶家族,成员3 | - - - - - - | HPRD | 10436013 |
| PIGK | GPI8 | MGC22559 | 磷脂酰肌醇锚多糖生物合成、类K | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 12582175 |
| PRKCSH | AGE-R2 | G19P1 | PCLD | PLD1 | 蛋白激酶C衬底80 k - h | - - - - - - | HPRD | 8910335 |
| SERP1 | MGC117327 | MGC133321 | MGC133322 | RAMP4 | 跟压力内质网蛋白1 | - - - - - - | HPRD | 10601334 |
| SLC2A1 | 过剩DYT17 | DYT18 | | GLUT1 | MGC141895 | MGC141896 | PED | 溶质载体家庭2(促进葡萄糖转运体),成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8662691 |
| SLC4A1 | DI AE1 | BND3 | CD233 | | EMPB3 | EPB3 | FR | MGC116750 | MGC116753 | MGC126619 | MGC126623 | RTA1A | |西南WD | WD1 |弯角 | 溶质载体家庭4,阴离子交换剂,1(红细胞膜蛋白带3,迭戈血型) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10364201 |
| SLC6A4 | 计画计画5 - HTT基因| 5 | | OCD1 |泽特| hSERT | 溶质载体家庭6(5 -羟色胺神经递质转运体),成员4 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10364189 |
| 特遣部队 | DKFZp781D0156 | PRO1557 | PRO2086 | 转铁蛋白 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9312001 |
| TG | AITD3 | TGN | 甲状腺球蛋白 | - - - - - - | HPRD | 10636893 |
| TRA@ | FLJ22602 | MGC117436 | MGC22624 | MGC23964 | MGC71411 | TCRA | TCRD |交易 | T细胞受体α轨迹 | - - - - - - | HPRD | 11566319 |
| TSHR | CHNG1 | LGR3 | MGC75129 | hTSHR-I | 促甲状腺激素受体 | 促甲状腺激素受体与分子伴侣蛋白calnexin交互。这种交互是仿照人类TSHR和狗calnexin证明之间的交互。 | 绑定 | 12383251 |
| TSHR | CHNG1 | LGR3 | MGC75129 | hTSHR-I | 促甲状腺激素受体 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12383251 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG抗原处理和表示 | 89年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME MHC II级抗原 | 91年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢的蛋白质 | 518年 | 242年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME平移蛋白质改性 | 188年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME天冬酰胺N糖基化有关 | 81年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME CALNEXIN CALRETICULIN周期 | 11 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME N多糖修剪的ER和CALNEXIN CALRETICULIN周期 | 13 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME流感生命周期 | 203年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME免疫系统 | 933年 | 616年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME适应性免疫系统 | 539年 | 350年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME折叠组装和肽抗原呈递我MHC加载类 | 21 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME类我MHC抗原介导的处理报告 | 251年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过CD40 DN HOLLMANN细胞凋亡 | 267年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAZDA钻石BLACKFAN贫血红细胞DN | 493年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PRAMOONJAGO SOX4目标 | 51 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN HORIUCHI WTAP目标 | 310年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 大黄酸糖皮质激素治疗DN | 362年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌24小时DN | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WAMUNYOKOLI卵巢癌LMP DN | 199年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺癌分化不良 | 633年 | 376年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HAHTOLA蕈样DN | 16 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李在肺癌放大 | 178年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HATADA甲基化在肺癌 | 390年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 前列腺癌·汤姆林了 | 40 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌症发展和BOX4 DN | 32 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不知道背景目标1 DN | 169年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 挞挞浆细胞和B淋巴细胞 | 78年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOLDRATH稳态扩散 | 171年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER PBL肾移植好的VS捐赠者DN | 41 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NING慢性阻塞性肺病DN | 121年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER PBL肾移植排斥和好的 | 63年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阮NOTCH1目标了 | 29日 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MUNSHI多发性骨髓瘤起来 | 81年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗兹癌症元签名 | 64年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 江下丘脑衰老DN | 40 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 江VHL目标 | 138年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 朋友PRMT5 DN的目标 | 29日 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RODWELL肾脏老化了 | 487年 | 303年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAMASWAMY转移了 | 66年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 江缺氧正常 | 311年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BAELDE糖尿病肾病DN | 434年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PELLICCIOTTA HDAC在抗原表达DN | 49 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1 DN的目标 | 543年 | 317年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯DN TP53的目标 | 593年 | 372年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53目标DN | 591年 | 366年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 年级结肠癌和直肠癌 | 38 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔葡萄糖剥夺 | 60 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布卢姆SALIRASIB反应 | 245年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤侵袭性DN | 210年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOHN原发性免疫缺陷症侯群 | 47 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢弗IRF4多发性骨髓瘤的程序 | 36 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHAFFER IRF4目标骨髓瘤和成熟的B淋巴细胞 | 101年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢弗IRF4目标B淋巴细胞浆细胞和成熟 | 67年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢弗IRF4目标激活B淋巴细胞 | 81年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢弗IRF4目标激活树突状细胞 | 65年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧管家基因 | 389年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗马胰岛素在肌肉的目标 | 442年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 酒井法子慢性肝炎和肝癌 | 83年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝母细胞癌类了 | 605年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 古铁雷斯多发性骨髓瘤起来 | 35 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党由MYC DN | 253年 | 192年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群10 | 69年 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KYNG响应通过ERCC6过氧化氢 | 40 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过VHL江缺氧 | 34 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 | 682年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4同种型 | 182年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 128 | 858年 | 864年 | m8 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| miR-130/301 | 1543年 | 1549年 | m8 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
| hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
| hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
| mir - 139 | 204年 | 210年 | 1 | hsa - mir - 139大脑 | UCUACAGUGCACGUGUCU |
| miR-148/152 | 1544年 | 1551年 | 1、m8 | hsa - mir - 148 a | UCAGUGCACUACAGAACUUUGU |
| hsa - mir - 152大脑 | UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG | ||||
| hsa - mir - 148 b | UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU | ||||
| mir - 153 | 918年 | 924年 | m8 | hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| mir - 205 | 1616年 | 1622年 | m8 | hsa - mir - 205 | UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG |
| miR-29 | 1403年 | 1409年 | 1 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| miR-30-3p | 1461年 | 1467年 | m8 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
| hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC | ||||
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
| mir - 374 | 965年 | 971年 | 1 | hsa - mir - 374 | UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG |
| mir - 494 | 1009年 | 1015年 | m8 | hsa - mir - 494大脑 | UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU |
| mir - 496 | 1280年 | 1286年 | m8 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |
| mir - 505 | 864年 | 870年 | m8 | hsa - mir - 505 | GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC |