Summary
基因 822
象征 CAPG
同义词 AFCP|HEL-S-66|MCP
描述 限额肌动蛋白蛋白,类似凝胶蛋白
Reference MIM:153615|HGNC:HGNC:1474|Ensembl:ENSG00000042493|HPRD:01088|Vega:OTTHUMG00000130183
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P11.2
Pascal P值 0.017
Sherlock p-value 0.363
胎儿β -0.069
主持人 小脑半球
小脑
伏隔核基底神经节
支持 CompositeSet

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I Genome scan meta-analysis PSR:0.0004
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AP2M1 0.89 0.86
OTUB1 0.89 0.86
FAM127A 0.86 0.83
MAPRE3 0.86 0.82
ATP6V0D1 0.86 0.84
FLOT1 0.84 0.82
MLF2 0.84 0.83
BSCL2 0.84 0.82
GPI 0.84 0.79
WIPI2 0.83 0.78
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.56 -0.27
AF347015.18 -0.55 -0.30
AF347015.2 -0.49 -0.24
AF347015.8 -0.48 -0.25
AC010300.1 -0.47 -0.38
AF347015.26 -0.47 -0.23
MT-CO2 -0.47 -0.25
鼻孔 -0.46 -0.27
MT-ATP8 -0.46 -0.26
mt-cyb -0.45 -0.24

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0003779 肌动蛋白结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0030031 细胞投射生物发生 IEA Axon(GO术语级别:8) -
去:0006461 protein complex assembly nas 1322908
去:0051016 带刺肌动蛋白细丝封盖 TAS 1322908
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 nucleus IEA -
去:0005737 cytoplasm IEA -
GO:0008290 F-肌动蛋白上限蛋白复合物 TAS 1322908
GO:0042470 黑色素体 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
家长mtor信号向上 567 375 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WATANABE RECTAL CANCER RADIOTHERAPY RESPONSIVE DN 92 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘前列腺癌DN 481 290 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP 276 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
gal白血病干细胞DN 244 153 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan mll签名1 380 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MULLIGHAN毫升L SIGNATURE 2 UP 418 263 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE UP 530 342 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌 443 294 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 UP 58 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN UP 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP UP 69 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ozanne AP1靶向 18 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应 134 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 1 DN 38 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PATIL LIVER CANCER 747 453 All SZGR 2.0 genes in this pathway
狮子转移 539 324 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼转移DN 261 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WU细胞迁移 184 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori大型BII淋巴细胞DN 58 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori未成熟B淋巴细胞向上 53 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
克莱因原发性积液淋巴瘤DN 58 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ross AML带有MLL融合 78 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕色髓样细胞的发育 165 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
纳德勒肥胖 61 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中岛肥大细胞 46 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML Fab标记 191 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BASSO CD40 SIGNALING UP 101 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HASLINGER B CLL WITH 6Q21 DELETION 20 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN 408 274 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAL PRMT5靶向 203 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WANG CISPLATIN RESPONSE AND XPC DN 228 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kuninger IGF1 vs PDGFB目标DN 46 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成8 86 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
tseng irs1靶向DN 135 88 All SZGR 2.0 genes in this pathway
江缺氧正常 311 205 All SZGR 2.0 genes in this pathway
尼尔森平滑肌肉瘤了 18 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR UP 783 442 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈里斯脑癌祖细胞 44 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gavin Foxp3目标集群T4 94 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GAVIN FOXP3 TARGETS CLUSTER P4 100 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
海勒被甲基化沉默 282 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fujii YBX1靶向 43 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌 871 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Labbe TGFB1靶向 102 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Qi Plasmacytoma Up 259 185 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GOLDRATH ANTIGEN RESPONSE 346 192 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindstedt树突状细胞成熟C 69 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗斯白血病与MLL融合 78 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE DN 72 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK 1210 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位 368 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH 11Q23 REARRANGED 351 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 128 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 174 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARSON FOXP3目标 66 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇6的时间反应6 75 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
li诱导了自然杀手 307 182 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标汇合 567 365 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Servitja Islet HNF1A靶向 163 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 All SZGR 2.0 genes in this pathway
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞DN 428 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway