基因页：DGCR14
概括？
| 基因 | 8220 |
| 象征 | DGCR14 |
| 同义词 | DGCR13 | DGS-H | DGS-I | DGSH | DGSI | ES2 | ES2EL |
| 描述 | Digeorge综合征关键区域基因14 |
| 参考 | MIM：601755|HGNC：HGNC：16817|Ensembl：ENSG00000100056|HPRD：03452|HPRD：18586|Vega：Otthumg00000150119 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22Q11.21 | 22Q11.2 |
| Pascal P值 | 0.015 |
| Sherlock P值 | 0.303 |
| 胎儿β | -0.578 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BCKDK | 0.83 | 0.81 |
| SLC35A4 | 0.83 | 0.84 |
| MFSD5 | 0.82 | 0.81 |
| 克拉特 | 0.81 | 0.78 |
| PQLC2 | 0.81 | 0.83 |
| 鸽子 | 0.81 | 0.80 |
| SLC5A2 | 0.80 | 0.77 |
| HSD17B1 | 0.80 | 0.79 |
| tesk1 | 0.79 | 0.81 |
| B4GALT7 | 0.79 | 0.78 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.58 | -0.57 |
| AF347015.31 | -0.55 | -0.50 |
| MT-ATP8 | -0.52 | -0.57 |
| AF347015.8 | -0.52 | -0.50 |
| MT-CO2 | -0.52 | -0.48 |
| AF347015.27 | -0.52 | -0.49 |
| mt-cyb | -0.50 | -0.47 |
| AF347015.33 | -0.47 | -0.44 |
| AF347015.2 | -0.47 | -0.44 |
| AL139819.3 | -0.47 | -0.48 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | ISS | 神经突（GO期限：5） | 8703114 |
| 去：0006397 | mRNA处理 | IEA | - | |
| 去：0008380 | RNA剪接 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | ISS | 8703114 | |
| 去：0005681 | 剪接体 | IEA | - | |
| 去：0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合目标G DN | 35 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN | 20 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li DCP2绑定mRNA | 89 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 1616年 | 1622 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-130/301 | 2060 | 2066 | M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-205 | 1941年 | 1947年 | 1a | HSA-MIR-205 | uccuucauucccggagucug |
| mir-26 | 2420 | 2426 | M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
| mir-324-5p | 2225 | 2231 | M8 | HSA-MIR-324-5p | CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGU |
| mir-335 | 1937年 | 1943年 | 1a | HSA-MIR-335脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU |
| mir-378* | 2093 | 2099 | M8 | HSA-MIR-422B | cuggacuuggagagaaggcc |
| HSA-MIR-422A | cuggacuagggucagaaggcc | ||||
| mir-505 | 2349 | 2355 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |