基因页：SYN3
概括？
| 基因 | 8224 |
| 象征 | SYN3 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 突触III |
| 参考 | MIM：602705|HGNC：HGNC：11496|ENSEMBL：ENSG00000185666|HPRD：04083|Vega：Otthumg00000031004 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22q12.3 |
| Pascal P值 | 0.044 |
| 支持 | canabinoid 多巴胺 胞吞作用 5-羟色胺 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TFAP2C | 0.86 | 0.50 |
| DMRTA2 | 0.84 | 0.49 |
| GPC4 | 0.84 | 0.52 |
| LRIG3 | 0.84 | 0.29 |
| Col4a6 | 0.80 | 0.68 |
| NHLH1 | 0.80 | 0.49 |
| SOX3 | 0.75 | 0.58 |
| CELSR1 | 0.75 | 0.60 |
| jub | 0.74 | 0.44 |
| itga2 | 0.73 | 0.28 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LGI4 | -0.23 | -0.32 |
| SLC16A11 | -0.21 | -0.55 |
| SLC9A3R2 | -0.21 | -0.49 |
| FBXO2 | -0.21 | -0.65 |
| C5orf53 | -0.21 | -0.64 |
| ADAP1 | -0.21 | -0.41 |
| asphd1 | -0.21 | -0.57 |
| TMEM54 | -0.20 | -0.49 |
| TNFSF12 | -0.20 | -0.59 |
| LHPP | -0.20 | -0.57 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003824 | 催化活性 | IEA | - | |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007269 | 神经递质分泌 | IEA | 神经元，轴突，突触，5-羟色胺，神经递质，多巴胺（GO期限：8） | - |
| 去：0007269 | 神经递质分泌 | 塔斯 | 神经元，轴突，突触，5-羟色胺，神经递质，多巴胺（GO期限：8） | 9539796 |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008021 | 突触囊泡 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：12） | - |
| 去：0008021 | 突触囊泡 | 塔斯 | 突触，神经递质（GO期限：12） | 9539796 |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - | |
| GO：0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经递质释放周期 | 34 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组多巴胺神经递质释放周期 | 11 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mantovani NFKB目标 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mantovani病毒GPCR信号向上 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF持续DN | 61 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-452 | 462 | 469 | 1A，M8 | HSA-MIR-452 | UguuugcaggaaacugagaC |