概括
基因 8241
象征 RBM10
同义词 DXS8237E | GPATC9 | GPATCH9 | S1-1 | TARPS | ZRANB5
描述 RNA结合基序蛋白10
参考 MIM:300080|HGNC:HGNC:9896|ENSEMBL:ENSG00000182872|HPRD:02095|Vega:Otthumg0000000021432
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XP11.23
Sherlock P值 0.352
胎儿β -0.826
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17762315 CHR5 76807576 RBM10 8241 0.08 反式
RS4265582 Chr11 18797649 RBM10 8241 0.2 反式
RS1265412 Chrx 147942079 RBM10 8241 0.1 反式
RS5936455 Chrx 147949110 RBM10 8241 0.13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Hist1h2ae 0.71 0.51
EIF3G 0.67 0.60
Hist1h2bg 0.67 0.44
SLC25A6 0.66 0.62
C7orf11 0.65 0.57
SNRPC 0.65 0.61
PQBP1 0.65 0.61
fars2 0.65 0.57
thoc4 0.65 0.57
EEF1D 0.65 0.56
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.42 -0.49
mt-cyb -0.41 -0.47
MT-CO2 -0.40 -0.44
AF347015.33 -0.40 -0.47
AF347015.8 -0.40 -0.47
AF347015.15 -0.39 -0.47
AF347015.31 -0.39 -0.44
AF347015.2 -0.38 -0.45
AF347015.26 -0.37 -0.45
C5orf53 -0.36 -0.39

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003676 核酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 nas -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008150 生物_Process nd -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 nas -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli Mgus vs PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子有Sox4结合位点 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 162 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng通过ERCC6 DN对H2O2的响应 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-326 115 121 1a HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag