基因页：KDM5C
概括？
| 基因 | 8242 |
| 象征 | KDM5C |
| 同义词 | dxs1272e | jarid1c | mrx13 | mrxj | mrxscj | mrxsj | smcx | xe169 |
| 描述 | 赖氨酸脱甲基酶5C |
| 参考 | MIM：314690|HGNC：HGNC：11114|ENSEMBL：ENSG00000126012|HPRD：02442|Vega：Otthumg0000000021606 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XP11.22-P11.21 |
| Sherlock P值 | 0.505 |
| TADA P值 | 0.004 |
| 胎儿β | 0.423 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 染色质重塑基因 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| KDM5C | Chrx | 53245325..53245326 | TC | t | NM_001146702 NM_004187 |
。 。 |
边框 边框 |
精神分裂症 | DNM：XU_2012 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4862188 | CHR4 | 184355369 | KDM5C | 8242 | 6.381E-4 | 反式 | ||
| RS2880301 | CHR13 | 20100533 | KDM5C | 8242 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 克雷布 | 0.98 | 0.98 |
| EP300 | 0.98 | 0.98 |
| EP400 | 0.97 | 0.97 |
| spen | 0.97 | 0.97 |
| Arid1a | 0.97 | 0.98 |
| DIDO1 | 0.96 | 0.98 |
| Zzef1 | 0.96 | 0.97 |
| C11orf30 | 0.96 | 0.97 |
| ZMIZ1 | 0.96 | 0.96 |
| GCN1L1 | 0.96 | 0.97 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.71 | -0.87 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.87 |
| C5orf53 | -0.69 | -0.75 |
| FXYD1 | -0.69 | -0.84 |
| AF347015.27 | -0.68 | -0.83 |
| S100B | -0.68 | -0.81 |
| ifi27 | -0.68 | -0.83 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.82 |
| higd1b | -0.67 | -0.86 |
| mt-cyb | -0.66 | -0.81 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Laiho结直肠癌锯齿状DN | 86 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MYC增强的Schlosser血清反应 | 108 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 史密斯·泰特（Smith Tert） | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cromer转移 | 79 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| faelt b cll与VH3 21 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo卡路里限制肌肉DN | 87 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV全部 | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |