基因页：SMC1A
概括？
| 基因 | 8243 |
| 象征 | SMC1A |
| 同义词 | CDLS2 | DXS423E | SB1.8 | SMC1 | SMC1L1 | SMC1ALPHA | SMCB |
| 描述 | 染色体的结构维护1a |
| 参考 | MIM：300040|HGNC：HGNC：11111|Ensembl：ENSG00000072501|HPRD：02077|Vega：Otthumg00000021614 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XP11.22-P11.21 |
| 胎儿β | 0.588 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17028363 | CHR2 | 41913161 | SMC1A | 8243 | 0.2 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | SMC1A | 8243 | 2.03e-28 | 反式 | ||
| RS16841750 | CHR2 | 158288461 | SMC1A | 8243 | 0.07 | 反式 | ||
| RS3845734 | CHR2 | 171125572 | SMC1A | 8243 | 0.04 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | SMC1A | 8243 | 1.767E-6 | 反式 | ||
| RS6741060 | CHR2 | 217169088 | SMC1A | 8243 | 0.06 | 反式 | ||
| RS9810143 | CHR3 | 5060209 | SMC1A | 8243 | 0.09 | 反式 | ||
| RS6797307 | CHR3 | 8601563 | SMC1A | 8243 | 0.13 | 反式 | ||
| SNP_A-1815771 | 0 | SMC1A | 8243 | 0.01 | 反式 | |||
| RS2183142 | CHR4 | 159232695 | SMC1A | 8243 | 1.239E-4 | 反式 | ||
| RS170776 | CHR4 | 173276735 | SMC1A | 8243 | 0.06 | 反式 | ||
| RS1396222 | CHR4 | 173279496 | SMC1A | 8243 | 0.06 | 反式 | ||
| RS335993 | CHR4 | 173321789 | SMC1A | 8243 | 0.11 | 反式 | ||
| RS335980 | CHR4 | 173329784 | SMC1A | 8243 | 0.03 | 反式 | ||
| RS335982 | CHR4 | 173330945 | SMC1A | 8243 | 0.13 | 反式 | ||
| RS337984 | CHR4 | 173411662 | SMC1A | 8243 | 0.1 | 反式 | ||
| RS17762315 | CHR5 | 76807576 | SMC1A | 8243 | 0.01 | 反式 | ||
| RS10474151 | CHR5 | 84286402 | SMC1A | 8243 | 0.02 | 反式 | ||
| SNP_A-4218600 | 0 | SMC1A | 8243 | 0 | 反式 | |||
| RS13360496 | 0 | SMC1A | 8243 | 0.07 | 反式 | |||
| RS12196880 | CHR6 | 24313746 | SMC1A | 8243 | 0.19 | 反式 | ||
| RS10806988 | CHR6 | 24341768 | SMC1A | 8243 | 0.05 | 反式 | ||
| RS9461864 | CHR6 | 33481468 | SMC1A | 8243 | 0.04 | 反式 | ||
| RS16890367 | CHR6 | 38078448 | SMC1A | 8243 | 0.11 | 反式 | ||
| RS7787830 | CHR7 | 98797019 | SMC1A | 8243 | 9.247E-4 | 反式 | ||
| RS6996695 | CHR8 | 77540580 | SMC1A | 8243 | 0.03 | 反式 | ||
| RS9406868 | Chr9 | 25223372 | SMC1A | 8243 | 0.2 | 反式 | ||
| RS11139334 | Chr9 | 84209393 | SMC1A | 8243 | 0 | 反式 | ||
| SNP_A-2108530 | 0 | SMC1A | 8243 | 0.11 | 反式 | |||
| RS11061703 | CHR12 | 1436977 | SMC1A | 8243 | 0.19 | 反式 | ||
| RS7337967 | CHR13 | 53519044 | SMC1A | 8243 | 0.04 | 反式 | ||
| RS9989228 | CHR14 | 37809252 | SMC1A | 8243 | 0.06 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | SMC1A | 8243 | 3.788e-24 | 反式 | ||
| RS2077735 | CHR15 | 58479024 | SMC1A | 8243 | 0.07 | 反式 | ||
| RS9941296 | CHR16 | 2759498 | SMC1A | 8243 | 0.02 | 反式 | ||
| RS16945437 | CHR17 | 11797650 | SMC1A | 8243 | 0.03 | 反式 | ||
| RS11873184 | CHR18 | 1584081 | SMC1A | 8243 | 0.01 | 反式 | ||
| RS12458173 | CHR18 | 31430166 | SMC1A | 8243 | 0.07 | 反式 | ||
| RS11882889 | CHR19 | 19887684 | SMC1A | 8243 | 0.19 | 反式 | ||
| RS7274477 | CHR20 | 1676942 | SMC1A | 8243 | 0.02 | 反式 | ||
| RS1041786 | CHR21 | 22617710 | SMC1A | 8243 | 5.099E-4 | 反式 | ||
| RS16986332 | Chrx | 10958354 | SMC1A | 8243 | 0.09 | 反式 | ||
| RS16990575 | Chrx | 32691327 | SMC1A | 8243 | 0.2 | 反式 | ||
| RS16993189 | Chrx | 144666166 | SMC1A | 8243 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ATM | AT1 |ata |ATC |ATD |ATDC |吃饭|DKFZP781A0353 |MGC74674 |Tel1 |Telo1 | 毛细血管炎突变 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11877376 |
| BLM | BS |MGC126616 |MGC131618 |MGC131620 |recq2 |recql2 |RECQL3 | 布卢姆综合症 | - | HPRD | 11877377 |
| BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1，早发 | - | HPRD | 11877377 |
| CASP4 | 冰（Rel）II |ICEREL-II |ICH-2 |mih1/tx |TX | caspase 4，与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| CDK4 | CMM3 |MGC14458 |PSK-J3 | 细胞周期蛋白依赖性激酶4 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| CHTF18 | C16orf41 |C321d2.2 |C321d2.3 |C321d2.4 |chl12 |CTF18 |ruvbl | CTF18，染色体传播保真度因子18同源物（S. cerevisiae） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12930902 |
| MDC1 | DKFZP781A0122 |KIAA0170 |MGC166888 |NFBD1 | DNA损伤检查点1 | - | HPRD | 12607005 |
| MSH2 | 可口可乐|FCC1 |HNPCC |HNPCC1 |LCFS2 | MUTS同源物2，结肠癌，非型型1型（大肠杆菌） | - | HPRD | 14657349 |
| MSH6 | GTBP |HNPCC5 |HSAP | MUTS同源物6（大肠杆菌） | 重构的复合物 | Biogrid | 14657349 |
| NDC80 | Hec |Hec1 |kntc2 |tid3 |HSNDC80 | NDC80同源物，动力学复合物成分（S. cerevisiae） | - | HPRD，Biogrid | 9295362 |
| numa1 | numa | 核有丝分裂设备蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 11590136 |
| RAD21 | FLJ25655 |FLJ40596 |HR21 |hrad21 |KIAA0078 |MCD1 |NXP1 |SCC1 |HHR21 | RAD21同源物（S. Pombe） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11590136 |
| rec8 | HR21SPB |MGC950 |rec8l1 |REC8P | REC8同源物（酵母） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12759374 |
| Smarca5 | ISWI |snf2h |WCRF135 |HISWI |HSNF2H | SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族A，成员5 | 共纯化 | Biogrid | 12198550 |
| SMC3 | bam |BMH |CDLS3 |CSPG6 |HCAP |SMC3L1 | 染色体的结构维护3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9789013|11590136 |11877376|12759374 |
| SMC3 | bam |BMH |CDLS3 |CSPG6 |HCAP |SMC3L1 | 染色体的结构维护3 | - | HPRD | 9789013|11076961 |
| Stag1 | DKFZP781D1416 |SA1 | 基质抗原1 | 共纯化 | Biogrid | 11076961 |
| Styxl1 | dusp24 |Mk-Styx | 丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸相互作用1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| Sycp3 | cor1 |MGC71888 |scp3 | 突触核复合蛋白3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12759374 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞周期 | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ATM路径 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 | 140 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA剪接 | 111 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有丝分裂M M G1相 | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组有丝分裂起点 | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chow rassf1靶向 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 受甲基化DN调节的Missiaglia | 122 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mattioli Mgus vs PCL | 116 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana乳腺癌点燃int网络 | 101 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA XPRSS INT网络 | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA中心网络 | 117 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 | 110 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 考夫曼DNA复制基因 | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cromer转移 | 79 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 艾布拉姆森与艾尔互动 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |