SZGR2 - Beplay体育中心

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GeneID	8290
Symbol	HIST3H3
同义词	H3.4 \| H3/G \| H3FT \| H3T
描述	组蛋白簇3，H3
参考	MIM：602820\|HGNC：HGNC：4778\|Ensembl:ENSG00000168148\|HPRD：04156\|Vega：Otthumg00000040044
基因类型	蛋白质编码
地图位置	1q42
胎儿β	-0.761
DMG	1（＃研究）

Gene in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	2

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

探测	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	beta（dis）	fdr（dis）	学习
CG11412256	1	228612818	HIST3H3	1.086E-4	0.27	0.028	DMG：Wockner_2014
CG25955816	1	228612876	HIST3H3	5.068e-4	0.316	0.047	DMG：Wockner_2014

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
AOF2	BHC110 \|KDM1 \|KIAA0601 \|LSD1	胺氧化酶（含黄素）结构域2	LSD1与H3相互作用并脱甲基。	绑定	15620353
ASF1A	CGI-98 \|中央情报局\|DKFZP547E2110 \|HSPC146	ASF1抗沉降函数1同源物A（S. cerevisiae）	H3与ASF1A相互作用。	绑定	15664198
Ash2l	Ash2 \|ASH2L1 \|ASH2L2 \|bre2	ASH2（不存在，小或同源） - 像（果蝇）	重构的复合物	Biogrid	12482968
BIRC3	AIP1 \| API2 \| CIAP2 \| HAIP1 \| HIAP1 \| MALT2 \| MIHC \| RNF49	细菌病毒IAP重复含量3	CIAP-2启动子与磷酸化和/或乙酰化H3相互作用。	绑定	15494311
BRD7	BP75 \|Celtix1 \|Nag4	含有7的溴结构域	-	HPRD	12489984
dnttip2	ERBP \|FCF2 \|HSU15552 \|LPTS-RP2 \|MGC163494 \|RP4-561L24.1 \|TDIF2	脱氧核苷酸转移酶，末端，相互作用蛋白2	-	HPRD	12786946
dyrk2	FLJ21217 \|FLJ21365	双特异性酪氨酸（Y） - 磷酸化调节激酶2	-	HPRD	9748265
FOXA1	HNF3A \|MGC33105 \|TCF3A	叉子盒A1	-	HPRD	11864602
GTF3C4	FLJ21002 \| KAT12 \| MGC138450 \| TFIII90 \| TFIIIC90 \| TFIIICdelta \| TFiiiC2-90	一般转录因子IIIC，多肽4，90KDA	-	HPRD	10523658
HIRIP3	-	HIRA相互作用蛋白3	-	HPRD	9710638
IL8	CXCL8 \|GCP-1 \|GCP1 \|Lect \|吊\|lynap \|mdncf \|MONAP \|NAF \|NAP-1 \| NAP1	白介素8	IL-8启动子与磷酸化和/或乙酰化H3相互作用。	绑定	15494311
KPNA1	IPOA5 \|NPI-1 \|RCH2 \|SRP1	核桃蛋白α1（importin alpha 5）	-	HPRD	11824786
MCM2	BM28 \|ccnl1 \|CDCL1 \|D3S3194 \|KIAA0030 \|MGC10606 \|米托蛋白\|CDC19	微型鲜体维护复杂组件2	-	HPRD，Biogrid	8798650
MCM7	CDABP0042 \|cdc47 \|MCM2 \|P1.1-MCM3 \|P1CDC47 \|p85mcm \|PNAS-146	微型鲜体维护复杂组件7	-	HPRD，Biogrid	8798650
MDM2	HDMX \|MGC71221 \|HDM2	MDM2 p53结合蛋白同源物（小鼠）	MDM2与H3相互作用。	绑定	15546622
NAP1L4	MGC4565 \| NAP2 \| NAP2L \| hNAP2	核小体组装蛋白1类样4	-	HPRD	9325046
NPM1	B23 \|MGC104254 \|NPM	核素蛋白（核酸磷酸蛋白B23，numatrin）	-	HPRD，Biogrid	11602260
PADI4	垫\|pad4 \|padi5 \|PDI4 \|PDI5	肽基精氨酸脱氨酶，IV型	PAD4与组蛋白H3相互作用并脱甲基映射。	绑定	15345777
PGR	NR3C3 \|PR	孕酮受体	H3与PGRA启动子相互作用。	绑定	15019994
PGR	NR3C3 \|PR	孕酮受体	H3与PGRB启动子相互作用。	绑定	15019994
PTMA	MGC104802 \|TMSA	螺赛蛋白，α	-	HPRD	11310559
RAD51L1	MGC34245 \|R51H2 \|rad51b \|rec2 \|HREC2	rad51样1（酿酒酵母）	RAD51B interacts with H3.	绑定	14595808
放	2pp2a \|i2pp2a \|igaad \|ipp2a2 \|phapii \|taf-i \|taf-ibeta	设置核癌	-	HPRD，Biogrid	11163245
SIRT1	sir2l1	sirtuin (silent mating type information regulation 2 homolog) 1 (S. cerevisiae)	SIRT1与H3相互作用并脱乙酰基。	绑定	15469825
smyd3	FLJ21080 \|MGC104324 \|zmynd1 \|Znfn3A1 \|BA74P14.1	放and MYND domain containing 3	生化活动	Biogrid	15235609
TAF1	Ba2r \|CCG1 \|CCGS \|dyt3 \|kat4 \|N-TAF1 \|NSCL2 \|\|P250 \|taf2a \| TAFII250	TAF1 RNA聚合酶II，TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，250KDA	-	HPRD	8980232
TFF1	BCEI \|D21S21 \|HP1.A \|HPS2 \|PNR-2 \|PS2	三叶因子1	H3与PS2启动子相互作用。	绑定	15019994
TNFSF10	apo2l \|apo-2l \|CD253 \|TL2 \|踪迹	肿瘤坏死因子（配体）超家族，成员10	乙酰化H3互动s with the TNFSF10 promoter.	绑定	15619633
TNPO1	IPO2 \|kpnb2 \|mip \|MIP1 \|trn	运输1	-	HPRD	11824786
TRPM7	chak \|chak1 \|FLJ20117 \|FLJ25718 \|ltrpc7 \|trp-plik	瞬态受体电位阳离子通道，亚家族M，成员7	-	HPRD，Biogrid	14594813

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
kegg系统性狼疮红斑	140	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome减数分裂	116	81	All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组细胞周期	421	253	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome染色体维护	122	80	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome减数分裂重组	86	62	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Meiotic Synapsis	73	57	All SZGR 2.0 genes in this pathway
端粒末端的反应组包装	48	40	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome端粒维护	75	57	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP	461	298	All SZGR 2.0 genes in this pathway
艾布拉姆森与艾尔互动	45	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway

基因页：HIST3H3