基因页：trrap
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| 基因ID | 8295 |
| 象征 | trrap |
| 同义词 | PAF350/400 | PAF400 | Staf40 | Tr-Ap | Tra1 |
| 描述 | 转化/转录结构域相关蛋白 |
| 参考 | MIM：603015|HGNC：HGNC：12347|ENSEMBL：ENSG00000196367|HPRD：04310|Vega：Otthumg00000150403 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7Q21.2-Q22.1 |
| Pascal P值 | 0.451 |
| Sherlock P值 | 0.496 |
| TADA P值 | 0.036 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| trrap | CHR7 | 98498329 | 一个 | t | NM_001244580 NM_003496 |
p.295i> f p.295i> f |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：XU_2012 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Hist1H3H | 0.65 | 0.25 |
| Hist1h2am | 0.61 | 0.20 |
| NEK2 | 0.61 | 0.40 |
| CENPN | 0.61 | 0.47 |
| cdc25b | 0.59 | 0.52 |
| 奥卡 | 0.59 | 0.31 |
| Hist2H2AC | 0.59 | 0.15 |
| exo1 | 0.59 | 0.23 |
| DSN1 | 0.58 | 0.45 |
| Hist1H2BJ | 0.58 | 0.26 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| emid1 | -0.22 | -0.26 |
| CCBE1 | -0.21 | -0.09 |
| SATB2 | -0.20 | -0.04 |
| SYCP3 | -0.19 | -0.18 |
| RPRM | -0.19 | -0.08 |
| CLDN10 | -0.19 | -0.10 |
| TLCD1 | -0.18 | -0.10 |
| Adamtsl3 | -0.18 | -0.07 |
| AF347015.21 | -0.18 | -0.11 |
| AC087071.1 | -0.18 | -0.23 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| actl6a | actl6 |arp4 |BAF53A |INO80K |MGC5382 | 类似肌动蛋白的6A | - | HPRD，Biogrid | 11839798 |
| C20ORF20 | EAF7 |FLJ10914 |MRG15BP |MRGBP |URCC4 | 染色体20开放阅读框20 | - | HPRD | 12963728 |
| E2F1 | E2F-1 |RBAP1 |rbbp3 |rbp3 | E2F转录因子1 | - | HPRD，Biogrid | 9708738 |
| EP400 | CAGH32 |DKFZP434I225 |FLJ42018 |FLJ45115 |P400 |TNRC12 | E1A结合蛋白p400 | - | HPRD，Biogrid | 11509179 |
| ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | ESR1（ER-Alpha）与TRRAP相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的ESR1与未指定物种的TRRAP之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12738788 |
| ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 12837248 |
| ING1 | p24ing1c |p33 |p33ing1 |p33ing1b |P47 |P47ing1a | 成长家族抑制剂，成员1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12015309 |
| kat2a | GCN5 |GCN5L2 |MGC102791 |PCAF-B |HGCN5 | K（赖氨酸）乙酰转移酶2A | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10611234 |
| kat2b | CAF |P |P/CAF |PCAF | K（赖氨酸）乙酰转移酶2B | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11509179|12660246 |
| 最大限度 | MGC10775 |MGC11225 |MGC18164 |MGC34679 |MGC36767 |BHLHD4 |ORF1 | MYC相关因素X | - | HPRD，Biogrid | 10611234 |
| 我的C | Bhlhe39 |c-myc | V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物（禽类） | - | HPRD，Biogrid | 9708738 |
| 我的C | Bhlhe39 |c-myc | V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物（禽类） | C-MYC与TRRAP相互作用。 | 绑定 | 12660246 |
| ruvbl1 | ECP54 |ino80h |NMP238 |Pontin |Pontin52 |RVB1 |tih1 |TIP49 |TIP49A | ruvb样1（大肠杆菌） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11839798 |
| tal1 | SCL |TCL5 |BHLHA17 |TAL-1 | T细胞急性淋巴细胞性白血病1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 16407974 |
| VDR | NR1I1 | 维生素D（1,25-二羟基维生素D3）受体 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 12837248 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta Pitx2途径 | 15 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID E2F途径 | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID MYC PATHWAY | 25 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Beta Catenin nuc途径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN | 180 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bilban b cll lpl up | 63 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAGY TFTC组件人类 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nagy Staga组件人类 | 15 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAGY PCAF组件人 | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tSAI RESPONSE TO IONIZING RADIATION | 149 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON | 76 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李胞苷类似物胞交毒性 | 15 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |